RANBP1

RANBP1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1K5D, 1K5G
Ідентифікатори
Символи	RANBP1, HTF9A, RAN binding protein 1
Зовнішні ІД	OMIM: 601180 MGI: 96269 HomoloGene: 21600 GeneCards: RANBP1
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0005097, GO:0005099, GO:0005100 GTPase activator activity • GDP-dissociation inhibitor activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • cadherin binding Клітинна компонента • цитоплазма • nuclear envelope • клітинне ядро • центросома • гіалоплазма • ядерна пора Біологічний процес • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity • intracellular transport • GO:0022415 viral process • GO:0072468 сигнальна трансдукція • ubiquitin-dependent protein catabolic process • GO:0048552 regulation of catalytic activity • protein import into nucleus • GO:0043146 spindle organization • positive regulation of mitotic centrosome separation • RNA export from nucleus • G1/S transition of mitotic cell cycle Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	5902	19385
Ensembl	ENSG00000099901	ENSMUSG00000005732
UniProt	P43487	P34022
RefSeq (мРНК)	NM_001278639 NM_001278640 NM_001278641 NM_002882	NM_011239
RefSeq (білок)	NP_001265568 NP_001265569 NP_001265570 NP_002873	NP_035369
Локус (UCSC)	Хр. 22: 20.12 – 20.13 Mb	Хр. 16: 18.06 – 18.07 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

RANBP1 (англ. RAN binding protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 22-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 201 амінокислот, а молекулярна маса — 23 310.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAAAKDTHED		HDTSTENTDE		SNHDPQFEPI		VSLPEQEIKT		LEEDEEELFK
MRAKLFRFAS		ENDLPEWKER		GTGDVKLLKH		KEKGAIRLLM		RRDKTLKICA
NHYITPMMEL		KPNAGSDRAW		VWNTHADFAD		ECPKPELLAI		RFLNAENAQK
FKTKFEECRK		EIEEREKKAG		SGKNDHAEKV		AEKLEALSVK		EETKEDAEEK
Q

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів гтфаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як ацетилювання, альтернативний сплайсинг.

Література

• Impens F., Radoshevich L., Cossart P., Ribet D. (2014). Mapping of SUMO sites and analysis of SUMOylation changes induced by external stimuli. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 111: 12432—12437. PMID 25114211 DOI:10.1073/pnas.1413825111
• Hendriks I.A., Treffers L.W., Verlaan-de Vries M., Olsen J.V., Vertegaal A.C. (2015). SUMO-2 orchestrates chromatin modifiers in response to DNA damage. Cell Rep. 10: 1778—1791. PMID 25772364 DOI:10.1016/j.celrep.2015.02.033
• Bischoff F.R., Krebber H., Smirnova E., Dong W., Ponstingl H. (1995). Co-activation of RanGTPase and inhibition of GTP dissociation by Ran-GTP binding protein RanBP1. EMBO J. 14: 705—715. PMID 7882974

Див. також

• Хромосома 22