RAP1GAP

RAP1GAP
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1SRQ, 3BRW
Ідентифікатори
Символи	RAP1GAP, RAP1GA1, RAP1GAP1, RAP1GAPII, RAPGAP, RAP1 GTPase activating protein
Зовнішні ІД	OMIM: 600278 MGI: 109338 HomoloGene: 2163 GeneCards: RAP1GAP
Онтологія гена Молекулярна функція • protein homodimerization activity • GO:0005083 GTPase regulator activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0006184 GTPase activity • GO:0005097, GO:0005099, GO:0005100 GTPase activator activity Клітинна компонента • комплекс Ґольджі • мембрана • Golgi membrane • гіалоплазма Біологічний процес • negative regulation of microvillus assembly • GO:0043087, GO:0032313, GO:0032319, GO:0032314, GO:0043088 regulation of GTPase activity • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity • regulation of small GTPase mediated signal transduction • GO:0072468 сигнальна трансдукція • axon guidance Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	5909	110351
Ensembl	ENSG00000076864	ENSMUSG00000041351
UniProt	P47736	A2ALS5
RefSeq (мРНК)	NM_001145657 NM_001145658 NM_002885 NM_001330383 NM_001350524 NM_001350525 NM_001350526 NM_001350527 NM_001350528	NM_001081155 NM_001256218 NM_029563 NM_001331215
RefSeq (білок)	NP_001139129 NP_001139130 NP_001317312 NP_002876 NP_001337453 NP_001337454 NP_001337455 NP_001337456 NP_001337457	NP_001074624 NP_001243147 NP_001318144 NP_083839 NP_001366162 NP_001366163 NP_001366164 NP_001366165
Локус (UCSC)	Хр. 1: 21.6 – 21.67 Mb	Хр. 4: 137.66 – 137.73 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

RAP1GAP (англ. RAP1 GTPase activating protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 663 амінокислот, а молекулярна маса — 73 361.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MIEKMQGSRM		DEQRCSFPPP		LKTEEDYIPY		PSVHEVLGRE		GPFPLILLPQ
FGGYWIEGTN		HEITSIPETE		PLQSPTTKVK		LECNPTARIY		RKHFLGKEHF
NYYSLDAALG		HLVFSLKYDV		IGDQEHLRLL		LRTKCRTYHD		VIPISCLTEF
PNVVQMAKLV		CEDVNVDRFY		PVLYPKASRL		IVTFDEHVIS		NNFKFGVIYQ
KLGQTSEEEL		FSTNEESPAF		VEFLEFLGQK		VKLQDFKGFR		GGLDVTHGQT
GTESVYCNFR		NKEIMFHVST		KLPYTEGDAQ		QLQRKRHIGN		DIVAVVFQDE
NTPFVPDMIA		SNFLHAYVVV		QAEGGGPDGP		LYKVSVTARD		DVPFFGPPLP
DPAVFRKGPE		FQEFLLTKLI		NAEYACYKAE		KFAKLEERTR		AALLETLYEE
LHIHSQSMMG		LGGDEDKMEN		GSGGGGFFES		FKRVIRSRSQ		SMDAMGLSNK
KPNTVSTSHS		GSFAPNNPDL		AKAAGISLIV		PGKSPTRKKS		GPFGSRRSSA
IGIENIQEVQ		EKRESPPAGQ		KTPDSGHVSQ		EPKSENSSTQ		SSPEMPTTKN
RAETAAQRAE		ALKDFSRSSS		SASSFASVVE		ETEGVDGEDT		GLESVSSSGT
PHKRDSFIYS		TWLEDSVSTT		SGGSSPGPSR		SPHPDAGKLG		DPACPEIKIQ
LEASEQHMPQ		LGC

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів гтфаз, фосфопротеїнів. Локалізований у мембрані, апараті гольджі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Daumke O., Weyand M., Chakrabarti P.P., Vetter I.R., Wittinghofer A. (2004). The GTPase-activating protein Rap1GAP uses a catalytic asparagine. Nature. 429: 197—201. PMID 15141215 DOI:10.1038/nature02505
• Scrima A., Thomas C., Deaconescu D., Wittinghofer A. (2008). The Rap-RapGAP complex: GTP hydrolysis without catalytic glutamine and arginine residues. EMBO J. 27: 1145—1153. PMID 18309292 DOI:10.1038/emboj.2008.30

Див. також

• Хромосома 1