RAPGEF6

RAPGEF6
Наявні структури PDB Пошук для людей: PDBe RCSB Список кодів PDB 2D93, 3LNY
Ідентифікатори
Символи	RAPGEF6, KIA001LB, PDZ-GEF2, PDZGEF2, RA-GEF-2, RAGEF2, Rap guanine nucleotide exchange factor 6
Зовнішні ІД	OMIM: 610499 MGI: 2384761 HomoloGene: 22968 GeneCards: RAPGEF6
Онтологія гена Молекулярна функція • phosphatidic acid binding • GTP-dependent protein binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • guanyl-nucleotide exchange factor activity Клітинна компонента • цитоплазма • гіалоплазма • клітинна мембрана • endocytic vesicle • apical plasma membrane • мембрана • центросома Біологічний процес • GO:0043087, GO:0032313, GO:0032319, GO:0032314, GO:0043088 regulation of GTPase activity • small GTPase mediated signal transduction • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity • Ras protein signal transduction • microvillus assembly • protein localization to plasma membrane • establishment of endothelial intestinal barrier • GO:0072468 сигнальна трансдукція Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	51735	192786
Ensembl	ENSG00000158987	ENSMUSG00000037533
UniProt	Q8TEU7	н/д
RefSeq (мРНК)	NM_016340 NM_001164386 NM_001164387 NM_001164388 NM_001164389 NM_001164390	NM_001252494 NM_001252496 NM_001252497 NM_001252498 NM_175258
RefSeq (білок)	NP_001157858 NP_001157859 NP_001157860 NP_001157861 NP_001157862 NP_057424	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 5: 131.42 – 131.64 Mb	Хр. 11: 54.41 – 54.59 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

RAPGEF6 (англ. Rap guanine nucleotide exchange factor 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 601 амінокислот, а молекулярна маса — 179 423.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MNSPVDPGAR		QALRKKPPER		TPEDLNTIYS		YLHGMEILSN		LREHQLRLMS
ARARYERYSG		NQVLFCSETI		ARCWYILLSG		SVLVKGSMVL		PPCSFGKQFG
GKRGCDCLVL		EPSEMIVVEN		AKDNEDSILQ		REIPARQSRR		RFRKINYKGE
RQTITDDVEV		NSYLSLPADL		TKMHLTENPH		PQVTHVSSSQ		SGCSIASDSG
SSSLSDIYQA		TESEVGDVDL		TRLPEGPVDS		EDDEEEDEEI		DRTDPLQGRD
LVRECLEKEP		ADKTDDDIEQ		LLEFMHQLPA		FANMTMSVRR		ELCSVMIFEV
VEQAGAIILE		DGQELDSWYV		ILNGTVEISH		PDGKVENLFM		GNSFGITPTL
DKQYMHGIVR		TKVDDCQFVC		IAQQDYWRIL		NHVEKNTHKV		EEEGEIVMVH
EHRELDRSGT		RKGHIVIKAT		PERLIMHLIE		EHSIVDPTYI		EDFLLTYRTF
LESPLDVGIK		LLEWFKIDSL		RDKVTRIVLL		WVNNHFNDFE		GDPAMTRFLE
EFEKNLEDTK		MNGHLRLLNI		ACAAKAKWRQ		VVLQKASRES		PLQFSLNGGS
EKGFGIFVEG		VEPGSKAADS		GLKRGDQIME		VNGQNFENIT		FMKAVEILRN
NTHLALTVKT		NIFVFKELLF		RTEQEKSGVP		HIPKIAEKKS		NRHSIQHVPG
DIEQTSQEKG		SKKVKANTVS		GGRNKIRKIL		DKTRFSILPP		KLFSDGGLSQ
SQDDSIVGTR		HCRHSLAIMP		IPGTLSSSSP		DLLQPTTSML		DFSNPSDIPD
QVIRVFKVDQ		QSCYIIISKD		TTAKEVVFHA		VHEFGLTGAS		DTYSLCEVSV
TPEGVIKQRR		LPDQFSKLAD		RIQLNGRYYL		KNNMETETLC		SDEDAQELVK
ESQLSMLQLS		TIEVATQLSM		RDFDLFRNIE		PTEYIDDLFK		LNSKTGNTHL
KRFEDIVNQE		TFWVASEILT		EANQLKRMKI		IKHFIKIALH		CRECKNFNSM
FAIISGLNLA		SVARLRGTWE		KLPSKYEKHL		QDLQDIFDPS		RNMAKYRNIL
SSQSMQPPII		PLFPVVKKDM		TFLHEGNDSK		VDGLVNFEKL		RMISKEIRQV
VRMTSANMDP		AMMFRQRSLS		QGSTNSNMLD		VQGGAHKKRA		RRSSLLNAKK
LYEDAQMARK		VKQYLSSLDV		ETDEEKFQMM		SLQWEPAYGT		LTKNLSEKRS
AKSSEMSPVP		MRSAGQTTKA		HLHQPHRVSQ		VLQVPAVNLH		PIRKKGQTKD
PALNTSLPQK		VLGTTEEISG		KKHTEDTISV		ASSLHSSPPA		SPQGSPHKGY
TLIPSAKSDN		LSDSSHSEIS		SRSSIVSNCS		VDSMSAALQD		ERCSSQALAV
PESTGALEKT		EHASGIGDHS		QHGPGWTLLK		PSLIKCLAVS		SSVSNEEISQ
EHIIIEAADS		GRGSWTSCSS		SSHDNFQSLP		NPKSWDFLNS		YRHTHLDDPI
AEVEPTDSEP		YSCSKSCSRT		CGQCKGSLER		KSWTSSSSLS		DTYEPNYGTV
KQRVLESTPA		ESSEGLDPKD		ATDPVYKTVT		SSTEKGLIVY		CVTSPKKDDR
YREPPPTPPG		YLGISLADLK		EGPHTHLKPP		DYSVAVQRSK		MMHNSLSRLP
PASLSSNLVA		CVPSKIVTQP		QRHNLQPFHP		KLGDVTDADS		EADENEQVSA
V

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як ацетилювання, альтернативний сплайсинг, поліморфізм. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, мембрані.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 5