RAPH1

RAPH1
Наявні структури PDB Пошук для людей: PDBe RCSB Список кодів PDB 4GMV, 4GN1
Ідентифікатори
Символи	RAPH1, ALS2CR18, ALS2CR9, LPD, PREL-2, PREL2, RMO1, RalGDS/AF-6, Ras association (RalGDS/AF-6) and pleckstrin homology domains 1
Зовнішні ІД	OMIM: 609035 MGI: 1924550 HomoloGene: 71030 GeneCards: RAPH1
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • цитоплазма • Філоподія • cell projection • цитоскелет • cell leading edge • мембрана • lamellipodium • гіалоплазма • клітинна мембрана • ядерні тільця Біологічний процес • GO:0072468 сигнальна трансдукція • axon extension Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	65059	77300
Ensembl	ENSG00000173166	ENSMUSG00000026014
UniProt	Q70E73	н/д
RefSeq (мРНК)	NM_025252 NM_203365 NM_213589 NM_001329728	NM_001045513
RefSeq (білок)	NP_001316657 NP_976241 NP_998754	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 2: 203.39 – 203.54 Mb	Хр. 1: 60.52 – 60.61 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

RAPH1 (англ. Ras association (RalGDS/AF-6) and pleckstrin homology domains 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 250 амінокислот, а молекулярна маса — 135 256.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MEQLSDEEID		HGAEEDSDKE		DQDLDKMFGA		WLGELDKLTQ		SLDSDKPMEP
VKRSPLRQET		NMANFSYRFS		IYNLNEALNQ		GETVDLDALM		ADLCSIEQEL
SSIGSGNSKR		QITETKATQK		LPVSRHTLKH		GTLKGLSSSS		NRIAKPSHAS
YSLDDVTAQL		EQASLSMDEA		AQQSVLEDTK		PLVTNQHRRT		ASAGTVSDAE
VHSISNSSHS		SITSAASSMD		SLDIDKVTRP		QELDLTHQGQ		PITEEEQAAK
LKAEKIRVAL		EKIKEAQVKK		LVIRVHMSDD		SSKTMMVDER		QTVRQVLDNL
MDKSHCGYSL		DWSLVETVSE		LQMERIFEDH		ENLVENLLNW		TRDSQNKLIF
MERIEKYALF		KNPQNYLLGK		KETAEMADRN		KEVLLEECFC		GSSVTVPEIE
GVLWLKDDGK		KSWKKRYFLL		RASGIYYVPK		GKAKVSRDLV		CFLQLDHVNV
YYGQDYRNKY		KAPTDYCLVL		KHPQIQKKSQ		YIKYLCCDDV		RTLHQWVNGI
RIAKYGKQLY		MNYQEALKRT		ESAYDWTSLS		SSSIKSGSSS		SSIPESQSNH
SNQSDSGVSD		TQPAGHVRSQ		SIVSSVFSEA		WKRGTQLEES		SKARMESMNR
PYTSLVPPLS		PQPKIVTPYT		ASQPSPPLPP		PPPPPPPPPP		PPPPPPPPLP
SQSAPSAGSA		APMFVKYSTI		TRLQNASQHS		GALFKPPTPP		VMQSQSVKPQ
ILVPPNGVVP		PPPPPPPPPT		PGSAMAQLKP		APCAPSLPQF		SAPPPPLKIH
QVQHITQVAP		PTPPPPPPIP		APLPPQAPPK		PLVTIPAPTS		TKTVAPVVTQ
AAPPTPTPPV		PPAKKQPAFP		ASYIPPSPPT		PPVPVPPPTL		PKQQSFCAKP
PPSPLSPVPS		VVKQIASQFP		PPPTPPAMES		QPLKPVPANV		APQSPPAVKA
KPKWQPSSIP		VPSPDFPPPP		PESSLVFPPP		PPSPVPAPPP		PPPPTASPTP
DKSGSPGKKT		SKTSSPGGKK		PPPTPQRNSS		IKSSSGAEHP		EPKRPSVDSL
VSKFTPPAES		GSPSKETLPP		PAAPPKPGKL		NLSGVNLPGV		LQQGCVSAKA
PVLSGRGKDS		VVEFPSPPSD		SDFPPPPPET		ELPLPPIEIP		AVFSGNTSPK
VAVVNPQPQQ		WSKMSVKKAP		PPTRPKRNDS		TRLTQAEISE		QPTMATVVPQ
VPTSPKSSLS		VQPGFLADLN		RTLQRKSITR		HGSLSSRMSR		AEPTATMDDM
ALPPPPPELL		SDQQKAGYGG		SHISGYATLR		RGPPPAPPKR		DQNTKLSRDW

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як поліморфізм, ацетиляція, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, цитоскелеті, мембрані, клітинних відростках.

Література

• Michael M., Vehlow A., Navarro C., Krause M. (2010). c-Abl, Lamellipodin, and Ena/VASP proteins cooperate in dorsal ruffling of fibroblasts and axonal morphogenesis. Curr. Biol. 20: 783—791. PMID 20417104 DOI:10.1016/j.cub.2010.03.048
• Quinn C.C., Pfeil D.S., Wadsworth W.G. (2008). CED-10/Rac1 mediates axon guidance by regulating the asymmetric distribution of MIG-10/lamellipodin. Curr. Biol. 18: 808—813. PMID 18499456 DOI:10.1016/j.cub.2008.04.050

Див. також

• Хромосома 2