RBM47

RBM47
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2DIS
Ідентифікатори
Символи	RBM47, NET18, RNA binding motif protein 47
Зовнішні ІД	MGI: 2384294 HomoloGene: 36932 GeneCards: RBM47
Онтологія гена Молекулярна функція • nucleic acid binding • RNA binding • mRNA binding Клітинна компонента • клітинне ядро Біологічний процес • hematopoietic progenitor cell differentiation • cytidine to uridine editing Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	54502	245945
Ensembl	ENSG00000163694	ENSMUSG00000070780
UniProt	A0AV96	Q91WT8
RefSeq (мРНК)	NM_001098634 NM_019027 NM_001371113 NM_001371114	NM_001127382 NM_001291226 NM_139065 NM_178446
RefSeq (білок)	NP_001092104 NP_061900 NP_001358042 NP_001358043	NP_001120854 NP_001278155 NP_620704 NP_848541
Локус (UCSC)	Хр. 4: 40.42 – 40.63 Mb	Хр. 5: 66.17 – 66.33 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

RBM47 (англ. RNA binding motif protein 47) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 593 амінокислот, а молекулярна маса — 64 099.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MTAEDSTAAM		SSDSAAGSSA		KVPEGVAGAP		NEAALLALME		RTGYSMVQEN
GQRKYGGPPP		GWEGPHPQRG		CEVFVGKIPR		DVYEDELVPV		FEAVGRIYEL
RLMMDFDGKN		RGYAFVMYCH		KHEAKRAVRE		LNNYEIRPGR		LLGVCCSVDN
CRLFIGGIPK		MKKREEILEE		IAKVTEGVLD		VIVYASAADK		MKNRGFAFVE
YESHRAAAMA		RRKLMPGRIQ		LWGHQIAVDW		AEPEIDVDED		VMETVKILYV
RNLMIETTED		TIKKSFGQFN		PGCVERVKKI		RDYAFVHFTS		REDAVHAMNN
LNGTELEGSC		LEVTLAKPVD		KEQYSRYQKA		ARGGGAAEAA		QQPSYVYSCD
PYTLAYYGYP		YNALIGPNRD		YFVKAGSIRG		RGRGAAGNRA		PGPRGSYLGG
YSAGRGIYSR		YHEGKGKQQE		KGYELVPNLE		IPTVNPVAIK		PGTVAIPAIG
AQYSMFPAAP		APKMIEDGKI		HTVEHMISPI		AVQPDPASAA		AAAAAAAAAA
AAVIPTVSTP		PPFQGRPITP		VYTVAPNVQR		IPTAGIYGAS		YVPFAAPATA
TIATLQKNAA		AAAAMYGGYA		GYIPQAFPAA		AIQVPIPDVY		QTY

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах як поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 4