RC3H1

RC3H1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3X1O, 4QIK, 4QIL, 4ULW, 4YWQ
Ідентифікатори
Символи	RC3H1, RNF198, ROQUIN, ring finger and CCCH-type domains 1, FHL6, IMDSHY
Зовнішні ІД	OMIM: 609424 MGI: 2685397 HomoloGene: 19036 GeneCards: RC3H1
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:1904264, GO:1904822, GO:0090622, GO:0090302 ubiquitin protein ligase activity • зв'язування з іоном металу • mRNA binding • RNA stem-loop binding • mRNA 3'-UTR binding • RNA binding • double-stranded RNA binding • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • zinc ion binding • transferase activity • miRNA binding Клітинна компонента • цитоплазма • P-body • cytoplasmic stress granule Біологічний процес • regulation of T cell proliferation • regulation of T cell activation • B cell homeostasis • spleen development • positive regulation of NIK/NF-kappaB signaling • T cell homeostasis • T cell proliferation • регуляція експресії генів • lymph node development • T follicular helper cell differentiation • negative regulation of T-helper cell differentiation • regulation of mRNA stability • positive regulation of mRNA catabolic process • regulation of germinal center formation • posttranscriptional regulation of gene expression • negative regulation of germinal center formation • negative regulation of B cell proliferation • cellular response to interleukin-1 • Убіквітин-залежний протеоліз • nuclear-transcribed mRNA catabolic process, deadenylation-dependent decay • P-body assembly • regulation of T cell receptor signaling pathway • nuclear-transcribed mRNA catabolic process • negative regulation of activated T cell proliferation • 3'-UTR-mediated mRNA destabilization • protein polyubiquitination • T cell receptor signaling pathway • negative regulation of T-helper 17 cell differentiation • regulation of miRNA metabolic process Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	149041	381305
Ensembl	ENSG00000135870	ENSMUSG00000040423
UniProt	Q5TC82	Q4VGL6
RefSeq (мРНК)	NM_001300850 NM_001300851 NM_001300852 NM_172071	NM_001024952
RefSeq (білок)	NP_001287779 NP_001287780 NP_001287781 NP_742068 NP_001287779.1	NP_001020123
Локус (UCSC)	Хр. 1: 173.93 – 174.02 Mb	Хр. 1: 160.73 – 160.8 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

RC3H1 (англ. Ring finger and CCCH-type domains 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 133 амінокислот, а молекулярна маса — 125 736.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MPVQAPQWTD		FLSCPICTQT		FDETIRKPIS		LGCGHTVCKM		CLNKLHRKAC
PFDQTTINTD		IELLPVNSAL		LQLVGAQVPE		QQPITLCSGV		EDTKHYEEAK
KCVEELALYL		KPLSSARGVG		LNSTTQSVLS		RPMQRKLVTL		VHCQLVEEEG
RIRAMRAARS		LGERTVTELI		LQHQNPQQLS		SNLWAAVRAR		GCQFLGPAMQ
EEALKLVLLA		LEDGSALSRK		VLVLFVVQRL		EPRFPQASKT		SIGHVVQLLY
RASCFKVTKR		DEDSSLMQLK		EEFRTYEALR		REHDSQIVQI		AMEAGLRIAP
DQWSSLLYGD		QSHKSHMQSI		IDKLQTPASF		AQSVQELTIA		LQRTGDPANL
NRLRPHLELL		ANIDPSPDAP		PPTWEQLENG		LVAVRTVVHG		LVDYIQNHSK
KGADQQQPPQ		HSKYKTYMCR		DMKQRGGCPR		GASCTFAHSQ		EELEKFRKMN
KRLVPRRPLS		ASLGQLNEVG		LPSAAILPDE		GAVDLPSRKP		PALPNGIVST
GNTVTQLIPR		GTDPSYDSSL		KPGKIDHLSS		SAPGSPPDLL		ESVPKSISAL
PVNPHSIPPR		GPADLPPMPV		TKPLQMVPRG		SQLYPAQQTD		VYYQDPRGAA
PPFEPAPYQQ		GMYYTPPPQC		VSRFVRPPPS		APEPAPPYLD		HYPPYLQERV
VNSQYGTQPQ		QYPPIYPSHY		DGRRVYPAPS		YTREEIFRES		PIPIEIPPAA
VPSYVPESRE		RYQQIESYYP		VAPHPTQIRP		SYLREPPYSR		LPPPPQPHPS
LDELHRRRKE		IMAQLEERKV		ISPPPFAPSP		TLPPTFHPEE		FLDEDLKVAG
KYKGNDYSQY		SPWSCDTIGS		YIGTKDAKPK		DVVAAGSVEM		MNVESKGMRD
QRLDLQRRAA		ETSDDDLIPF		GDRPTVSRFG		AISRTSKTIY		QGAGPMQAMA
PQGAPTKSIN		ISDYSPYGTH		GGWGASPYSP		HQNIPSQGHF		SERERISMSE
VASHGKPLPS		AEREQLRLEL		QQLNHQISQQ		TQLRGLEAVS		NRLVLQREAN
TLAGQSQPPP		PPPPKWPGMI		SSEQLSLELH		QVEREIGKRT		RELSMENQCS
LDMKSKLNTS		KQAENGQPEP		QNKVPAEDLT		LTFSDVPNGS		ALTQENISLL
SNKTSSLNLS		EDPEGGGDNN		DSQRSGVTPS		SAP

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, РНК. Локалізований у цитоплазмі.

Література

• Heissmeyer V., Vogel K.U. (2013). Molecular control of Tfh-cell differentiation by Roquin family proteins. Immunol. Rev. 253: 273—289. PMID 23550652 DOI:10.1111/imr.12056

Див. також

• Хромосома 1