RDH11

RDH11
Ідентифікатори
Символи	RDH11, ARSDR1, CGI82, HCBP12, MDT1, PSDR1, RALR1, SCALD, SDR7C1, RDJCSS, retinol dehydrogenase 11 (all-trans/9-cis/11-cis), retinol dehydrogenase 11
Зовнішні ІД	OMIM: 607849 MGI: 102581 HomoloGene: 100724 GeneCards: RDH11
Онтологія гена Молекулярна функція • oxidoreductase activity • GO:0050229 oxidoreductase activity, acting on the CH-OH group of donors, NAD or NADP as acceptor • NADP-retinol dehydrogenase activity • NAD-retinol dehydrogenase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • aldehyde dehydrogenase (NADP+) activity Клітинна компонента • integral component of membrane • внутрішньоклітинний • endoplasmic reticulum membrane • мембрана • ендоплазматичний ретикулум • photoreceptor inner segment Біологічний процес • retinoid metabolic process • retinol metabolic process • retinal metabolic process • adaptation of rhodopsin mediated signaling • зір • cellular detoxification of aldehyde Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	51109	17252
Ensembl	ENSG00000072042	н/д
UniProt	Q8TC12	Q9QYF1
RefSeq (мРНК)	NM_016026 NM_001252650	NM_021557 NM_001362269 NM_001362270
RefSeq (білок)	NP_001239579 NP_057110	NP_067532 NP_001349198 NP_001349199
Локус (UCSC)	Хр. 14: 67.68 – 67.7 Mb	н/д
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

RDH11 (англ. Retinol dehydrogenase 11 (all-trans/9-cis/11-cis)) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 14-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 318 амінокислот, а молекулярна маса — 35 386.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MVELMFPLLL		LLLPFLLYMA		APQIRKMLSS		GVCTSTVQLP		GKVVVVTGAN
TGIGKETAKE		LAQRGARVYL		ACRDVEKGEL		VAKEIQTTTG		NQQVLVRKLD
LSDTKSIRAF		AKGFLAEEKH		LHVLINNAGV		MMCPYSKTAD		GFEMHIGVNH
LGHFLLTHLL		LEKLKESAPS		RIVNVSSLAH		HLGRIHFHNL		QGEKFYNAGL
AYCHSKLANI		LFTQELARRL		KGSGVTTYSV		HPGTVQSELV		RHSSFMRWMW
WLFSFFIKTP		QQGAQTSLHC		ALTEGLEILS		GNHFSDCHVA		WVSAQARNET
IARRLWDVSC		DLLGLPID

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до оксидоредуктаз. Задіяний у таких біологічних процесах, як ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з НАДФ. Локалізований у мембрані, ендоплазматичному ретикулумі.

Література

• Lai C.-H., Chou C.-Y., Ch'ang L.-Y., Liu C.-S., Lin W.-C. (2000). Identification of novel human genes evolutionarily conserved in Caenorhabditis elegans by comparative proteomics. Genome Res. 10: 703—713. PMID 10810093 DOI:10.1101/gr.10.5.703
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Roni V., Carpio R., Wissinger B. (2007). Mapping of transcription start sites of human retina expressed genes. BMC Genomics. 8: 42—42. PMID 17286855 DOI:10.1186/1471-2164-8-42

Див. також

• Хромосома 14