RGMA

RGMA
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4UHY
Ідентифікатори
Символи	RGMA, RGM, repulsive guidance molecule family member a, repulsive guidance molecule BMP co-receptor a
Зовнішні ІД	OMIM: 607362 MGI: 2679262 HomoloGene: 10626 GeneCards: RGMA
Онтологія гена Молекулярна функція • transferrin receptor binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • coreceptor activity Клітинна компонента • anchored component of membrane • клітинна мембрана • ендоплазматичний ретикулум • мембрана Біологічний процес • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • BMP signaling pathway • negative regulation of axon regeneration • regulation of neuron projection development Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	56963	244058
Ensembl	ENSG00000182175	ENSMUSG00000070509
UniProt	Q96B86	Q6PCX7
RefSeq (мРНК)	NM_020211 NM_001166283 NM_001166286 NM_001166287 NM_001166288 NM_001166289	NM_177740
RefSeq (білок)	NP_001159755 NP_001159758 NP_001159759 NP_001159760 NP_001159761 NP_064596	NP_808408
Локус (UCSC)	Хр. 15: 93.04 – 93.09 Mb	Хр. 7: 73.03 – 73.07 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

RGMA (англ. Repulsive guidance molecule family member a) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 15-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 450 амінокислот, а молекулярна маса — 49 347.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MQPPRERLVV		TGRAGWMGMG		RGAGRSALGF		WPTLAFLLCS		FPAATSPCKI
LKCNSEFWSA		TSGSHAPASD		DTPEFCAALR		SYALCTRRTA		RTCRGDLAYH
SAVHGIEDLM		SQHNCSKDGP		TSQPRLRTLP		PAGDSQERSD		SPEICHYEKS
FHKHSATPNY		THCGLFGDPH		LRTFTDRFQT		CKVQGAWPLI		DNNYLNVQVT
NTPVLPGSAA		TATSKLTIIF		KNFQECVDQK		VYQAEMDELP		AAFVDGSKNG
GDKHGANSLK		ITEKVSGQHV		EIQAKYIGTT		IVVRQVGRYL		TFAVRMPEEV
VNAVEDWDSQ		GLYLCLRGCP		LNQQIDFQAF		HTNAEGTGAR		RLAAASPAPT
APETFPYETA		VAKCKEKLPV		EDLYYQACVF		DLLTTGDVNF		TLAAYYALED
VKMLHSNKDK		LHLYDRTRDL		PGRAAAGLPL		APRPLLGALV		PLLALLPVFC

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Hata K., Kaibuchi K., Inagaki S., Yamashita T. (2009). Unc5B associates with LARG to mediate the action of repulsive guidance molecule. J. Cell Biol. 184: 737—750. PMID 19273616 DOI:10.1083/jcb.200807029
• Endo M., Yamashita T. (2009). Inactivation of Ras by p120GAP via focal adhesion kinase dephosphorylation mediates RGMa-induced growth cone collapse. J. Neurosci. 29: 6649—6662. PMID 19458235 DOI:10.1523/JNEUROSCI.0927-09.2009

Див. також

• Хромосома 15