RIDA

RIDA
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1ONI
Ідентифікатори
Символи	RIDA, P14.5, PSP, UK114, HRSP12, Heat-responsive protein 12, reactive intermediate imine deaminase A homolog, hp14.5
Зовнішні ІД	OMIM: 602487 MGI: 1095401 HomoloGene: 4261 GeneCards: RIDA
Онтологія гена Молекулярна функція • protein homodimerization activity • ion binding • long-chain fatty acid binding • transition metal ion binding • hydrolase activity • RNA binding • deaminase activity • endoribonuclease activity, producing 3'-phosphomonoesters Клітинна компонента • гіалоплазма • мітохондрія • екзосома • клітинне ядро • цитоплазма • мітохондріальний матрикс • пероксисома Біологічний процес • розвиток нирки • lung development • G1 to G0 transition • response to lipid • brain development • response to salt • negative regulation of epithelial cell proliferation • RNA phosphodiester bond hydrolysis, endonucleolytic • organonitrogen compound catabolic process • negative regulation of translation • L-threonine catabolic process to glycine Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	10247	15473
Ensembl	ENSG00000132541	ENSMUSG00000022323
UniProt	P52758	P52760
RefSeq (мРНК)	NM_005836	NM_008287
RefSeq (білок)	NP_005827	NP_032313
Локус (UCSC)	Хр. 8: 98.1 – 98.12 Mb	Хр. 15: 34.48 – 34.5 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

RIDA (англ. Reactive intermediate imine deaminase A homolog) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 137 амінокислот, а молекулярна маса — 14 494.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSSLIRRVIS		TAKAPGAIGP		YSQAVLVDRT		IYISGQIGMD		PSSGQLVSGG
VAEEAKQALK		NMGEILKAAG		CDFTNVVKTT		VLLADINDFN		TVNEIYKQYF
KSNFPARAAY		QVAALPKGSR		IEIEAVAIQG		PLTTASL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як ацетилювання. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, мітохондрії, пероксисомах.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Samuel S.J., Tzung S.P., Cohen S.A. (1997). Hrp12, a novel heat-responsive, tissue-specific, phosphorylated protein isolated from mouse liver. Hepatology. 25: 1213—1222. PMID 9141440 DOI:10.1002/hep.510250525
• Lambrecht J.A., Browne B.A., Downs D.M. (2010). Members of the YjgF/YER057c/UK114 family of proteins inhibit phosphoribosylamine synthesis in vitro. J. Biol. Chem. 285: 34401—34407. PMID 20817725 DOI:10.1074/jbc.M110.160515
• Lambrecht J.A., Flynn J.M., Downs D.M. (2012). The conserved YjgF protein family deaminates enamine/imine intermediates of pyridoxal-5'-phosphate (PLP)-dependent enzyme reactions. J. Biol. Chem. 287: 3454—3461. PMID 22094463 DOI:10.1074/jbc.M111.304477

Див. також

• Хромосома 8