RNASE6

RNASE6
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4X09
Ідентифікатори
Символи	RNASE6, RAD1, RNS6, RNasek6, ribonuclease A family member k6
Зовнішні ІД	OMIM: 601981 MGI: 1925666 HomoloGene: 4102 GeneCards: RNASE6
Онтологія гена Молекулярна функція • nuclease activity • endonuclease activity • hydrolase activity • nucleic acid binding • ribonuclease activity Клітинна компонента • extracellular region • міжклітинний простір • внутрішньоклітинний • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • лізосома Біологічний процес • defense response • Деградація РНК • antimicrobial humoral response • antibacterial humoral response • вроджений імунітет • defense response to virus • antimicrobial humoral immune response mediated by antimicrobial peptide • RNA phosphodiester bond hydrolysis • defense response to bacterium • nucleic acid phosphodiester bond hydrolysis Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	6039	78416
Ensembl	ENSG00000169413	ENSMUSG00000021880
UniProt	Q93091 Q6IB39	Q9D244
RefSeq (мРНК)	NM_005615	NM_030098 NM_001360117
RefSeq (білок)	NP_005606 NP_005606.1	NP_084374 NP_001347046
Локус (UCSC)	Хр. 14: 20.78 – 20.78 Mb	Хр. 14: 51.36 – 51.37 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

RNASE6 (англ. Ribonuclease A family member k6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 14-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 150 амінокислот, а молекулярна маса — 17 196.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MVLCFPLLLL		LLVLWGPVCP		LHAWPKRLTK		AHWFEIQHIQ		PSPLQCNRAM
SGINNYTQHC		KHQNTFLHDS		FQNVAAVCDL		LSIVCKNRRH		NCHQSSKPVN
MTDCRLTSGK		YPQCRYSAAA		QYKFFIVACD		PPQKSDPPYK		LVPVHLDSIL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, нуклеаз, ендонуклеаз. Секретований назовні.

Література

• Rosenberg H.F., Dyer K.D. (1996). Molecular cloning and characterization of a novel human ribonuclease (RNase k6): increasing diversity in the enlarging ribonuclease gene family. Nucleic Acids Res. 24: 3507—3513. PMID 8836175 DOI:10.1093/nar/24.18.3507
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 14