RNF170

RNF170
Ідентифікатори
Символи	RNF170, ADSA, SNAX1, ring finger protein 170, sensory ataxia 1 (autosomal dominant), SPG85
Зовнішні ІД	OMIM: 614649 MGI: 1924983 HomoloGene: 12807 GeneCards: RNF170
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • transferase activity • GO:1904264, GO:1904822, GO:0090622, GO:0090302 ubiquitin protein ligase activity Клітинна компонента • integral component of membrane • endoplasmic reticulum membrane • ендоплазматичний ретикулум • мембрана Біологічний процес • Убіквітин-залежний протеоліз Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	81790	77733
Ensembl	ENSG00000120925	ENSMUSG00000013878
UniProt	Q96K19	Q8CBG9
RefSeq (мРНК)	NM_001160223 NM_001160224 NM_001160225 NM_030954	NM_029965 NM_001357292 NM_001357293 NM_001357294 NM_001357295
RefSeq (білок)	NP_001153695 NP_001153696 NP_001153697 NP_112216	NP_084241 NP_001344221 NP_001344222 NP_001344223 NP_001344224
Локус (UCSC)	Хр. 8: 42.85 – 42.9 Mb	Хр. 8: 26.61 – 26.64 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

RNF170 (англ. Ring finger protein 170) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 8-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 258 амінокислот, а молекулярна маса — 29 815.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAKYQGEVQS		LKLDDDSVIE		GVSDQVLVAV		VVSFALIATL		VYALFRNVHQ
NIHPENQELV		RVLREQLQTE		QDAPAATRQQ		FYTDMYCPIC		LHQASFPVET
NCGHLFCGAC		IIAYWRYGSW		LGAISCPICR		QTVTLLLTVF		GEDDQSQDVL
RLHQDINDYN		RRFSGQPRSI		MERIMDLPTL		LRHAFREMFS		VGGLFWMFRI
RIILCLMGAF		FYLISPLDFV		PEALFGILGF		LDDFFVIFLL		LIYISIMYRE
VITQRLTR

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до трансфераз. Задіяний у таких біологічних процесах, як убіквітинування білків, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у мембрані, ендоплазматичному ретикулумі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Lu J.P., Wang Y., Sliter D.A., Pearce M.M., Wojcikiewicz R.J. (2011). RNF170 protein, an endoplasmic reticulum membrane ubiquitin ligase, mediates inositol 1,4,5-trisphosphate receptor ubiquitination and degradation. J. Biol. Chem. 286: 24426—24433. PMID 21610068 DOI:10.1074/jbc.M111.251983

Див. також

• Хромосома 8