RNF19A

RNF19A
Ідентифікатори
Символи	RNF19A, RNF19, ring finger protein 19A, RBR E3 ubiquitin protein ligase
Зовнішні ІД	OMIM: 607119 MGI: 1353623 HomoloGene: 8501 GeneCards: RNF19A
Онтологія гена Молекулярна функція • transcription factor binding • ubiquitin conjugating enzyme binding • GO:1904264, GO:1904822, GO:0090622, GO:0090302 ubiquitin protein ligase activity • зв'язування з іоном металу • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity • transferase activity Клітинна компонента • цитоплазма • integral component of membrane • центр організації мікротрубочок • центросома • цитоскелет • мембрана • ubiquitin ligase complex • гіалоплазма • hippocampal mossy fiber to CA3 synapse • postsynapse • glutamatergic synapse Біологічний процес • microtubule cytoskeleton organization • positive regulation of proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process • Убіквітин-залежний протеоліз • protein polyubiquitination • regulation of protein catabolic process at postsynapse, modulating synaptic transmission • ubiquitin-dependent protein catabolic process Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	25897	30945
Ensembl	ENSG00000034677	ENSMUSG00000022280
UniProt	Q9NV58	P50636
RefSeq (мРНК)	NM_001280539 NM_015435 NM_183419 NM_001353837 NM_001353838	NM_013923 NM_001357631
RefSeq (білок)	NP_001267468 NP_056250 NP_904355 NP_001340766 NP_001340767	NP_038951 NP_001344560
Локус (UCSC)	Хр. 8: 100.26 – 100.34 Mb	Хр. 15: 36.24 – 36.28 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

RNF19A (англ. Ring finger protein 19A, RBR E3 ubiquitin protein ligase) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 838 амінокислот, а молекулярна маса — 90 696.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MQEQEIGFIS		KYNEGLCVNT		DPVSILTSIL		DMSLHRQMGS		DRDLQSSASS
VSLPSVKKAP		KKRRISIGSL		FRRKKDNKRK		SRELNGGVDG		IASIESIHSE
MCTDKNSIFS		TNTSSDNGLT		SISKQIGDFI		ECPLCLLRHS		KDRFPDIMTC
HHRSCVDCLR		QYLRIEISES		RVNISCPECT		ERFNPHDIRL		ILSDDVLMEK
YEEFMLRRWL		VADPDCRWCP		APDCGYAVIA		FGCASCPKLT		CGREGCGTEF
CYHCKQIWHP		NQTCDAARQE		RAQSLRLRTI		RSSSISYSQE		SGAAADDIKP
CPRCAAYIIK		MNDGSCNHMT		CAVCGCEFCW		LCMKEISDLH		YLSPSGCTFW
GKKPWSRKKK		ILWQLGTLVG		APVGIALIAG		IAIPAMIIGI		PVYVGRKIHN
RYEGKDVSKH		KRNLAIAGGV		TLSVIVSPVV		AAVTVGIGVP		IMLAYVYGVV
PISLCRSGGC		GVSAGNGKGV		RIEFDDENDI		NVGGTNTAVD		TTSVAEARHN
PSIGEGSVGG		LTGSLSASGS		HMDRIGAIRD		NLSETASTMA		LAGASITGSL
SGSAMVNCFN		RLEVQADVQK		ERYSLSGESG		TVSLGTVSDN		ASTKAMAGSI
LNSYIPLDKE		GNSMEVQVDI		ESKPSKFRHN		SGSSSVDDGS		ATRSHAGGSS
SGLPEGKSSA		TKWSKEATAG		KKSKSGKLRK		KGNMKINETR		EDMDAQLLEQ
QSTNSSEFEA		PSLSDSMPSV		ADSHSSHFSE		FSCSDLESMK		TSCSHGSSDY
HTRFATVNIL		PEVENDRLEN		SPHQCSISVV		TQTASCSEVS		QLNHIAEEHG
NNGIKPNVDL		YFGDALKETN		NNHSHQTMEL		KVAIQTEI

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як убіквітинування білків, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, мембрані.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Gunther M., Laithier M., Brison O. (2000). A set of proteins interacting with transcription factor Sp1 identified in a two-hybrid screening. Mol. Cell. Biochem. 210: 131—142. PMID 10976766 DOI:10.1023/A:1007177623283
• Huang Y., Niwa J., Sobue G., Breitwieser G.E. (2006). Calcium-sensing receptor ubiquitination and degradation mediated by the E3 ubiquitin ligase dorfin. J. Biol. Chem. 281: 11610—11617. PMID 16513638 DOI:10.1074/jbc.M513552200

Див. також

• Хромосома 8