RNF213

RNF213
Ідентифікатори
Символи	RNF213, ALO17, C17orf27, KIAA1618, MYMY2, MYSTR, NET57, ring finger protein 213
Зовнішні ІД	OMIM: 613768 MGI: 1289196 HomoloGene: 45439 GeneCards: RNF213
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • hydrolase activity • ATPase activity • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity • transferase activity Клітинна компонента • ядерце • мембрана • цитоплазма • гіалоплазма Біологічний процес • ubiquitin-dependent protein catabolic process • negative regulation of non-canonical Wnt signaling pathway • Ангіогенез • sprouting angiogenesis • protein homooligomerization • protein autoubiquitination • Убіквітин-залежний протеоліз • protein polyubiquitination Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	57674	672511
Ensembl	ENSG00000173821	ENSMUSG00000070327
UniProt	Q63HN8	н/д
RefSeq (мРНК)	NM_001256071 NM_020914 NM_020954	NM_001040005
RefSeq (білок)	NP_001243000 NP_066005	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 17: 80.26 – 80.4 Mb	Хр. 11: 119.28 – 119.38 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

RNF213 (англ. Ring finger protein 213) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 5 207 амінокислот, а молекулярна маса — 591 407.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MECPSCQHVS		KEETPKFCSQ		CGERLPPAAP		IADSENNNST		MASASEGEME
CGQELKEEGG		PCLFPGSDSW		QENPEEPCSK		ASWTVQESKK		KKRKKKKKGN
KSASSELASL		PLSPASPCHL		TLLSNPWPQD		TALPHSQAQQ		SGPTGQPSQP
PGTATTPLEG		DGLSAPTEVG		DSPLQAQALG		EAGVATGSEA		QSSPQFQDHT
EGEDQDASIP		SGGRGLSQEG		TGPPTSAGEG		HSRTEDAAQE		LLLPESKGGS
SEPGTELQTT		EQQAGASASM		AVDAVAEPAN		AVKGAGKEMK		EKTQRMKQPP
ATTPPFKTHC		QEAETKTKDE		MAAAEEKVGK		NEQGEPEDLK		KPEGKNRSAA
AVKNEKEQKN		QEADVQEVKA		STLSPGGGVT		VFFHAIISLH		FPFNPDLHKV
FIRGGEEFGE		SKWDSNICEL		HYTRDLGHDR		VLVEGIVCIS		KKHLDKYIPY
KYVIYNGESF		EYEFIYKHQQ		KKGEYVNRCL		FIKSSLLGSG		DWHQYYDIVY
MKPHGRLQKV		MNHITDGPRK		DLVKGKQIAA		ALMLDSTFSI		LQTWDTINLN
SFFTQFEQFC		FVLQQPMIYE		GQAQLWTDLQ		YREKEVKRYL		WQHLKKHVVP
LPDGKSTDFL		PVDCPVRSKL		KTGLIVLFVV		EKIELLLEGS		LDWLCHLLTS
DASSPDEFHR		DLSHILGIPQ		SWRLYLVNLC		QRCMDTRTYT		WLGALPVLHC
CMELAPRHKD		AWRQPEDTWA		ALEGLSFSPF		REQMLDTSSL		LQFMREKQHL
LSIDEPLFRS		WFSLLPLSHL		VMYMENFIEH		LGRFPAHILD		CLSGIYYRLP
GLEQVLNTQD		VQDVQNVQNI		LEMLLRLLDT		YRDKIPEEAL		SPSYLTVCLK
LHEAICSSTK		LLKFYELPAL		SAEIVCRMIR		LLSLVDSAGQ		RDETGNNSVQ
TVFQGTLAAT		KRWLREVFTK		NMLTSSGASF		TYVKEIEVWR		RLVEIQFPAE
HGWKESLLGD		MEWRLTKEEP		LSQITAYCNS		CWDTKGLEDS		VAKTFEKCII
EAVSSACQSQ		TSILQGFSYS		DLRKFGIVLS		AVITKSWPRT		ADNFNDILKH
LLTLADVKHV		FRLCGTDEKI		LANVTEDAKR		LIAVADSVLT		KVVGDLLSGT
ILVGQLELII		KHKNQFLDIW		QLREKSLSPQ		DEQCAVEEAL		DWRREELLLL
KKEKRCVDSL		LKMCGNVKHL		IQVDFGVLAV		RHSQDLSSKR		LNDTVTVRLS
TSSNSQRATH		YHLSSQVQEM		AGKIDLLRDS		HIFQLFWREA		AEPLSEPKED
QEAAELLSEP		EEESERHILE		LEEVYDYLYQ		PSYRKFIKLH		QDLKSGEVTL
AEIDVIFKDF		VNKYTDLDSE		LKIMCTVDHQ		DQRDWIKDRV		EQIKEYHHLH
QAVHAAKVIL		QVKESLGLNG		DFSVLNTLLN		FTDNFDDFRR		ETLDQINQEL
IQAKKLLQDI		SEARCKGLQA		LSLRKEFICW		VREALGGINE		LKVFVDLASI
SAGENDIDVD		RVACFHDAVQ		GYASLLFKLD		PSVDFSAFMK		HLKKLWKALD
KDQYLPRKLC		DSARNLEWLK		TVNESHGSVE		RSSLTLATAI		NQRGIYVIQA
PKGGQKISPD		TVLHLILPES		PGSHEESREY		SLEEVKELLN		KLMLMSGKKD
RNNTEVERFS		EVFCSVQRLS		QAFIDLHSAG		NMLFRTWIAM		AYCSPKQGVS
LQMDFGLDLV		TELKEGGDVT		ELLAALCRQM		EHFLDSWKRF		VTQKRMEHFY
LNFYTAEQLV		YLSTELRKQP		PSDAALTMLS		FIKSNCTLRD		VLRASVGCGS
EAARYRMRRV		MEELPLMLLS		EFSLVDKLRI		IMEQSMRCLP		AFLPDCLDLE
TLGHCLAHLA		GMGGSPVERC		LPRGLQVGQP		NLVVCGHSEV		LPAALAVYMQ
TPSQPLPTYD		EVLLCTPATT		FEEVALLLRR		CLTLGSLGHK		VYSLLFADQL
SYEVARQAEE		LFHNLCTQQH		REDYQLVMVC		DGDWEHCYLP		SAFSQHKVFV
TPQAPLEAIQ		AYLAGHYRVP		KQTLSAAAVF		NDRLCVGIVA		SERAGVGKSL
YVKRLHDKMK		MQLNVKNVPL		KTIRLIDPQV		DESRVLGALL		PFLDAQYQKV
PVLFHLDVTS		SVQTGIWVFL		FKLLILQYLM		DINGKMWLRN		PCHLYIVEIL
ERRTSVPSRS		SSALRTRVPQ		FSFLDIFPKV		TCRPPKEVID		MELSALRSDT
EPGMDLWEFC		SETFQRPYQY		LRRFNQNQDL		DTFQYQEGSV		EGTPEECLQH
FLFHCGVINP		SWSELRNFAR		FLNYQLRDCE		ASLFCNPSFI		GDTLRGFKKF
VVTFMIFMAR		DFATPSLHTS		DQSPGKHMVT		MDGVREEDLA		PFSLRKRWES
EPHPYVFFND		DHTTMTFIGF		HLQPNINGSV		DAISHLTGKV		IKRDVMTRDL
YQGLLLQRVP		FNVDFDKLPR		HKKLERLCLT		LGIPQATDPD		KTYELTTDNM
LKILAIEMRF		RCGIPVIIMG		ETGCGKTRLI		KFLSDLRRGG		TNADTIKLVK
VHGGTTADMI		YSRVREAENV		AFANKDQHQL		DTILFFDEAN		TTEAISCIKE
VLCDHMVDGQ		PLAEDSGLHI		IAACNPYRKH		SEEMICRLES		AGLGYRVSME
ETADRLGSIP		LRQLVYRVHA		LPPSLIPLVW		DFGQLSDVAE		KLYIQQIVQR
LVESISLDEN		GTRVITEVLC		ASQGFMRKTE		DECSFVSLRD		VERCVKVFRW
FHEHSAMLLA		QLNAFLSKSS		VSKNHTERDP		VLWSLMLAIG		VCYHASLEKK
DSYRKAIARF		FPKPYDDSRL		LLDEITRAQD		LFLDGVPLRK		TIAKNLALKE
NVFMMVVCIE		LKIPLFLVGK		PGSSKSLAKT		IVADAMQGPA		AYSDLFRSLK
QVHLVSFQCS		PHSTPQGIIS		TFRQCARFQQ		GKDLQQYVSV		VVLDEVGLAE
DSPKMPLKTL		HPLLEDGCIE		DDPAPHKKVG		FVGISNWALD		PAKMNRGIFV
SRGSPNETEL		IESAKGICSS		DILVQDRVQG		YFASFAKAYE		TVCKRQDKEF
FGLRDYYSLI		KMVFAAAKAS		NRKPSPQDIA		QAVLRNFSGK		DDIQALDIFL
ANLPEAKCSE		EVSPMQLIKQ		NIFGPSQKVP		GGEQEDAESR		YLLVLTKNYV
ALQILQQTFF		EGDQQPEIIF		GSGFPKDQEY		TQLCRNINRV		KICMETGKMV
LLLNLQNLYE		SLYDALNQYY		VHLGGQKYVD		LGLGTHRVKC		RVHPNFRLIV
IEEKDVVYKH		FPIPLINRLE		KHYLDINTVL		EKWQKSIVEE		LCAWVEKFIN
VKAHHFQKRH		KYSPSDVFIG		YHSDACASVV		LQVIERQGPR		ALTEELHQKV
SEEAKSILLN		CATPDAVVRL		SAYSLGGFAA		EWLSQEYFHR		QRHNSFADFL
QAHLHTADLE		RHAIFTEITT		FSRLLTSHDC		EILESEVTGR		APKPTLLWLQ
QFDTEYSFLK		EVRNCLTNTA		KCKILIFQTD		FEDGIRSAQL		IASAKYSVIN
EINKIRENED		RIFVYFITKL		SRVGRGTAYV		GFHGGLWQSV		HIDDLRRSTL
MVSDVTRLQH		VTISQLFAPG		DLPELGLEHR		AEDGHEEAME		TEASTSGEVA
EVAEEAMETE		SSEKVGKETS		ELGGSDVSIL		DTTRLLRSCV		QSAVGMLRDQ
NESCTRNMRR		VVLLLGLLNE		DDACHASFLR		VSKMRLSVFL		KKQEESQFHP
LEWLAREACN		QDALQEAGTF		RHTLWKRVQG		AVTPLLASMI		SFIDRDGNLE
LLTRPDTPPW		ARDLWMFIFS		DTMLLNIPLV		MNNERHKGEM		AYIVVQNHMN
LSENASNNVP		FSWKIKDYLE		ELWVQAQYIT		DAEGLPKKFV		DIFQQTPLGR
FLAQLHGEPQ		QELLQCYLKD		FILLTMRVST		EEELKFLQMA		LWSCTRKLKA
ASEAPEEEVS		LPWVHLAYQR		FRSRLQNFSR		ILTIYPQVLH		SLMEARWNHE
LAGCEMTLDA		FAAMACTEML		TRNTLKPSPQ		AWLQLVKNLS		MPLELICSDE
HMQGSGSLAQ		AVIREVRAQW		SRIFSTALFV		EHVLLGTESR		VPELQGLVTE
HVFLLDKCLR		ENSDVKTHGP		FEAVMRTLCE		CKETASKTLS		RFGIQPCSIC
LGDAKDPVCL		PCDHVHCLRC		LRAWFASEQM		ICPYCLTALP		DEFSPAVSQA
HREAIEKHAR		FRQMCNSFFV		DLVSTICFKD		NAPPEKEVIE		SLLSLLFVQK
GRLRDAAQRH		CEHTKSLSPF		NDVVDKTPVI		RSVILKLLLK		YSFHDVKDYI
QEYLTLLKKK		AFITEDKTEL		YMLFINCLED		SILEKTSAYS		RNDELNHLEE
EGRFLKAYSP		ASRGREPANE		ASVEYLQEVA		RIRLCLDRAA		DFLSEPEGGP
EMAKEKQCYL		QQVKQFCIRV		ENDWHRVYLV		RKLSSQRGME		FVQGLSKPGR
PHQWVFPKDV		VKQQGLRQDH		PGQMDRYLVY		GDEYKALRDA		VAKAVLECKP
LGIKTALKAC		KTPQSQQSAY		FLLTLFREVA		ILYRSHNASL		HPTPEQCEAV
SKFIGECKIL		SPPDISRFAT		SLVDNSVPLL		RAGPSDSNLD		GTVTEMAIHA
AAVLLCGQNE		LLEPLKNLAF		SPATMAHAFL		PTMPEDLLAQ		ARRWKGLERV
HWYTCPNGHP		CSVGECGRPM		EQSICIDCHA		PIGGIDHKPR		DGFHLVKDKA
DRTQTGHVLG		NPQRRDVVTC		DRGLPPVVFL		LIRLLTHLAL		LLGASQSSQA
LINIIKPPVR		DPKGFLQQHI		LKDLEQLAKM		LGHSADETIG		VVHLVLRRLL
QEQHQLSSRR		LLNFDTELST		KEMRNNWEKE		IAAVISPELE		HLDKTLPTMN
NLISQDKRIS		SNPVAKIIYG		DPVTFLPHLP		RKSVVHCSKI		WSCRKRITVE
YLQHIVEQKN		GKERVPILWH		FLQKEAELRL		VKFLPEILAL		QRDLVKQFQN
VQQVEYSSIR		GFLSKHSSDG		LRQLLHNRIT		VFLSTWNKLR		RSLETNGEIN
LPKDYCSTDL		DLDTEFEILL		PRRRGLGLCA		TALVSYLIRL		HNEIVYAVEK
LSKENNSYSV		DAAEVTELHV		ISYEVERDLT		PLILSNCQYQ		VEEGRETVQE
FDLEKIQRQI		VSRFLQGKPR		LSLKGIPTLV		YRHDWNYEHL		FMDIKNKMAQ
DSLPSSVISA		ISGQLQSYSD		ACEVLSVVEV		TLGFLSTAGG		DPNMQLNVYT
QDILQMGDQT		IHVLKALNRC		QLKHTIALWQ		FLSAHKSEQL		LRLHKEPFGE
ISSRYKADLS		PENAKLLSTF		LNQTGLDAFL		LELHEMIILK		LKNPQTQTEE
RFRPQWSLRD		TLVSYMQTKE		SEILPEMASQ		FPEEILLASC		VSVWKTAAVL
KWNREMR

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, гідролаз. Задіяний у таких біологічних процесах як ангіогенез, убіквітинування білків. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Nagase T., Kikuno R., Nakayama M., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVIII. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 273—281. PMID 10997877 DOI:10.1093/dnares/7.4.271
• Danelishvili L., Yamazaki Y., Selker J., Bermudez L.E. (2010). Secreted Mycobacterium tuberculosis Rv3654c and Rv3655c proteins participate in the suppression of macrophage apoptosis. PLoS ONE. 5: E10474—E10474. PMID 20454556 DOI:10.1371/journal.pone.0010474

Див. також

• Хромосома 17