RNF31

RNF31
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2CT7, 4DBG, 4JUY, 4LJO, 4LJP, 4LJQ, 4OWF, 4OYJ, 4OYK, 4P09, 4P0A, 4P0B, 5EDV
Ідентифікатори
Символи	RNF31, HOIP, ZIBRA, ring finger protein 31, Paul
Зовнішні ІД	OMIM: 612487 MGI: 1934704 HomoloGene: 33228 GeneCards: RNF31
Онтологія гена Молекулярна функція • зв'язування з іоном металу • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity • ubiquitin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ubiquitin protein ligase binding • transferase activity Клітинна компонента • цитоплазма • гіалоплазма • LUBAC complex • CD40 receptor complex • cytoplasmic side of plasma membrane Біологічний процес • positive regulation of protein targeting to mitochondrion • CD40 signaling pathway • regulation of tumor necrosis factor-mediated signaling pathway • protein polyubiquitination • positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity • positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling • I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling • T cell receptor signaling pathway • protein linear polyubiquitination • Убіквітин-залежний протеоліз Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	55072	268749
Ensembl	ENSG00000092098 ENSG00000285152	ENSMUSG00000047098
UniProt	Q96EP0	Q924T7
RefSeq (мРНК)	NM_017999 NM_001310332	NM_194346
RefSeq (білок)	NP_001297261 NP_060469	NP_919327
Локус (UCSC)	Хр. 14: 24.15 – 24.16 Mb	Хр. 14: 55.83 – 55.84 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

RNF31 (англ. Ring finger protein 31) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 14-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 072 амінокислот, а молекулярна маса — 119 652.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MPGEEEERAF		LVAREELASA		LRRDSGQAFS		LEQLRPLLAS		SLPLAARYLQ
LDAARLVRCN		AHGEPRNYLN		TLSTALNILE		KYGRNLLSPQ		RPRYWRGVKF
NNPVFRSTVD		AVQGGRDVLR		LYGYTEEQPD		GLSFPEGQEE		PDEHQVATVT
LEVLLLRTEL		SLLLQNTHPR		QQALEQLLED		KVEDDMLQLS		EFDPLLREIA
PGPLTTPSVP		GSTPGPCFLC		GSAPGTLHCP		SCKQALCPAC		DHLFHGHPSR
AHHLRQTLPG		VLQGTHLSPS		LPASAQPRPQ		STSLLALGDS		SLSSPNPASA
HLPWHCAACA		MLNEPWAVLC		VACDRPRGCK		GLGLGTEGPQ		GTGGLEPDLA
RGRWACQSCT		FENEAAAVLC		SICERPRLAQ		PPSLVVDSRD		AGICLQPLQQ
GDALLASAQS		QVWYCIHCTF		CNSSPGWVCV		MCNRTSSPIP		AQHAPRPYAS
SLEKGPPKPG		PPRRLSAPLP		SSCGDPEKQR		QDKMREEGLQ		LVSMIREGEA
AGACPEEIFS		ALQYSGTEVP		LQWLRSELPY		VLEMVAELAG		QQDPGLGAFS
CQEARRAWLD		RHGNLDEAVE		ECVRTRRRKV		QELQSLGFGP		EEGSLQALFQ
HGGDVSRALT		ELQRQRLEPF		RQRLWDSGPE		PTPSWDGPDK		QSLVRRLLAV
YALPSWGRAE		LALSLLQETP		RNYELGDVVE		AVRHSQDRAF		LRRLLAQECA
VCGWALPHNR		MQALTSCECT		ICPDCFRQHF		TIALKEKHIT		DMVCPACGRP
DLTDDTQLLS		YFSTLDIQLR		ESLEPDAYAL		FHKKLTEGVL		MRDPKFLWCA
QCSFGFIYER		EQLEATCPQC		HQTFCVRCKR		QWEEQHRGRS		CEDFQNWKRM
NDPEYQAQGL		AMYLQENGID		CPKCKFSYAL		ARGGCMHFHC		TQCRHQFCSG
CYNAFYAKNK		CPEPNCRVKK		SLHGHHPRDC		LFYLRDWTAL		RLQKLLQDNN
VMFNTEPPAG		ARAVPGGGCR		VIEQKEVPNG		LRDEACGKET		PAGYAGLCQA
HYKEYLVSLI		NAHSLDPATL		YEVEELETAT		ERYLHVRPQP		LAGEDPPAYQ
ARLLQKLTEE		VPLGQSIPRR		RK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як убіквітинування білків, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі.

Література

• Thompson H.G.R., Harris J.W., Lin L., Brody J.P. (2004). Identification of the protein Zibra, its genomic organization, regulation, and expression in breast cancer cells. Exp. Cell Res. 295: 448—459. PMID 15093743 DOI:10.1016/j.yexcr.2004.01.019
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 14