RNF5

RNF5
Ідентифікатори
Символи	RNF5, RING5, RMA1, ring finger protein 5
Зовнішні ІД	OMIM: 602677 MGI: 1860076 HomoloGene: 56004 GeneCards: RNF5
Онтологія гена Молекулярна функція • зв'язування з іоном металу • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ubiquitin-like protein conjugating enzyme binding • transferase activity • identical protein binding • zinc ion binding • GO:1904264, GO:1904822, GO:0090622, GO:0090302 ubiquitin protein ligase activity • GO:0032403 protein-containing complex binding Клітинна компонента • integral component of membrane • мітохондріальна мембрана • мембрана • мітохондрія • Derlin-1 retrotranslocation complex • ендоплазматичний ретикулум • endoplasmic reticulum membrane • endoplasmic reticulum quality control compartment Біологічний процес • response to bacterium • protein K63-linked ubiquitination • ER-associated misfolded protein catabolic process • regulation of autophagosome assembly • protein K48-linked ubiquitination • protein destabilization • Убіквітин-залежний протеоліз • negative regulation of autophagy • трансмембранний транспорт • endoplasmic reticulum mannose trimming • ubiquitin-dependent ERAD pathway • ERAD pathway • ubiquitin-dependent protein catabolic process Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	6048	54197
Ensembl	ENSG00000227277 ENSG00000223767 ENSG00000228907 ENSG00000183574 ENSG00000204308 ENSG00000225452 ENSG00000228405	ENSMUSG00000015478
UniProt	Q99942	O35445
RefSeq (мРНК)	NM_006913	NM_019403
RefSeq (білок)	NP_008844	NP_062276
Локус (UCSC)	Хр. 6: 32.18 – 32.18 Mb	Хр. 17: 34.82 – 34.82 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

RNF5 (англ. Ring finger protein 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 180 амінокислот, а молекулярна маса — 19 881.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAAAEEEDGG		PEGPNRERGG		AGATFECNIC		LETAREAVVS		VCGHLYCWPC
LHQWLETRPE		RQECPVCKAG		ISREKVVPLY		GRGSQKPQDP		RLKTPPRPQG
QRPAPESRGG		FQPFGDTGGF		HFSFGVGAFP		FGFFTTVFNA		HEPFRRGTGV
DLGQGHPASS		WQDSLFLFLA		IFFFFWLLSI

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як убіквітинування білків, ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у мембрані, мітохондрії, ендоплазматичному ретикулумі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Zhang Y., Higashide W., Dai S., Sherman D.M., Zhou D. (2005). Recognition and ubiquitination of Salmonella type III effector SopA by a ubiquitin E3 ligase, HsRMA1. J. Biol. Chem. 280: 38682—38688. PMID 16176924 DOI:10.1074/jbc.M506309200
• Kyushiki H., Kuga Y., Suzuki M., Takahashi E., Horie M. (1997). Cloning, expression and mapping of a novel RING-finger gene (RNF5), a human homologue of a putative zinc-finger gene from Caenorhabditis elegans. Cytogenet. Cell Genet. 79: 114—117. PMID 9533025
• Matsuda N., Suzuki T., Tanaka K., Nakano A. (2001). Rma1, a novel type of RING finger protein conserved from Arabidopsis to human, is a membrane-bound ubiquitin ligase. J. Cell Sci. 114: 1949—1957. PMID 11329381

Див. також

• Хромосома 6