RPE

RPE
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3OVQ, 3OVR, 3OVP, 3QC3
Ідентифікатори
Символи	RPE, RPE2-1, ribulose-5-phosphate-3-epimerase
Зовнішні ІД	OMIM: 180480 MGI: 1913896 HomoloGene: 12005 GeneCards: RPE
Онтологія гена Молекулярна функція • racemase and epimerase activity, acting on carbohydrates and derivatives • ribulose-phosphate 3-epimerase activity • каталітична активність • isomerase activity • protein homodimerization activity • зв'язування з іоном металу • identical protein binding Клітинна компонента • гіалоплазма • екзосома Біологічний процес • pentose catabolic process • Пентозофосфатний шлях • обмін речовин • pentose-phosphate shunt, non-oxidative branch • cellular carbohydrate metabolic process • carbohydrate metabolic process Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	6120	66646
Ensembl	ENSG00000197713	ENSMUSG00000026005
UniProt	Q96AT9	Q8VEE0
RefSeq (мРНК)	NM_001278282 NM_001278283 NM_001278285 NM_001278286 NM_001278288 NM_001278289 NM_006916 NM_199229 NM_001318926 NM_001318927 NM_001318928 NM_001318929 NM_001318930 NM_001318931	NM_025683 NM_001310642 NM_001310643 NM_001310644
RefSeq (білок)	NP_001265211 NP_001265212 NP_001265214 NP_001265215 NP_001265217 NP_001265218 NP_001305855 NP_001305856 NP_001305857 NP_001305858 NP_001305859 NP_001305860 NP_008847 NP_954699	NP_001297571 NP_001297572 NP_001297573 NP_079959
Локус (UCSC)	Хр. 2: 210 – 210.02 Mb	Хр. 1: 66.74 – 66.76 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

RPE (англ. Ribulose-5-phosphate-3-epimerase) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 228 амінокислот, а молекулярна маса — 24 928.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MASGCKIGPS		ILNSDLANLG		AECLRMLDSG		ADYLHLDVMD		GHFVPNITFG
HPVVESLRKQ		LGQDPFFDMH		MMVSKPEQWV		KPMAVAGANQ		YTFHLEATEN
PGALIKDIRE		NGMKVGLAIK		PGTSVEYLAP		WANQIDMALV		MTVEPGFGGQ
KFMEDMMPKV		HWLRTQFPSL		DIEVDGGVGP		DTVHKCAEAG		ANMIVSGSAI
MRSEDPRSVI		NLLRNVCSEA		AQKRSLDR

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до ізомераз. Задіяний у таких біологічних процесах як вуглеводний обмін, ацетиляція, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, іоном заліза, іоном марганцю, кобальтом.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 2