RPF1

RPF1
Ідентифікатори
Символи	RPF1, BXDC5, ribosome production factor 1 homolog
Зовнішні ІД	MGI: 1917535 HomoloGene: 68728 GeneCards: RPF1
Онтологія гена Молекулярна функція • rRNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • rRNA primary transcript binding • RNA binding Клітинна компонента • ядерце • preribosome, large subunit precursor • клітинне ядро Біологічний процес • rRNA processing • maturation of LSU-rRNA • ribosomal large subunit assembly • maturation of 5.8S rRNA • ribosome biogenesis Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	80135	70285
Ensembl	ENSG00000117133	ENSMUSG00000028187
UniProt	Q9H9Y2	Q7TND5
RefSeq (мРНК)	NM_025065	NM_027332 NM_027371
RefSeq (білок)	NP_079341	NP_081608 NP_081647
Локус (UCSC)	Хр. 1: 84.48 – 84.5 Mb	Хр. 3: 146.21 – 146.23 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

RPF1 (англ. Ribosome production factor 1 homolog) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 1-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 349 амінокислот, а молекулярна маса — 40 111.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAKAGDKSSS		SGKKSLKRKA		AAEELQEAAG		AGDGATENGV		QPPKAAAFPP
GFSISEIKNK		QRRHLMFTRW		KQQQRKEKLA		AKKKLKKERE		ALGDKAPPKP
VPKTIDNQRV		YDETTVDPND		EEVAYDEATD		EFASYFNKQT		SPKILITTSD
RPHGRTVRLC		EQLSTVIPNS		HVYYRRGLAL		KKIIPQCIAR		DFTDLIVINE
DRKTPNGLIL		SHLPNGPTAH		FKMSSVRLRK		EIKRRGKDPT		EHIPEIILNN
FTTRLGHSIG		RMFASLFPHN		PQFIGRQVAT		FHNQRDYIFF		RFHRYIFRSE
KKVGIQELGP		RFTLKLRSLQ		KGTFDSKYGE		YEWVHKPREM		DTSRRKFHL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг рРНК, біогенез рибосом. Білок має сайт для зв'язування з РНК, рРНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Wehner K.A., Baserga S.J. (2002). The sigma(70)-like motif: a eukaryotic RNA binding domain unique to a superfamily of proteins required for ribosome biogenesis. Mol. Cell. 9: 329—339. PMID 11864606 DOI:10.1016/S1097-2765(02)00438-0
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 1