RPRD2

RPRD2
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4FLB
Ідентифікатори
Символи	RPRD2, KIAA0460, HSPC099, regulation of nuclear pre-mRNA domain containing 2
Зовнішні ІД	OMIM: 614695 MGI: 1922387 HomoloGene: 19997 GeneCards: RPRD2
Онтологія гена Молекулярна функція • RNA polymerase II complex binding Клітинна компонента • RNA polymerase II, holoenzyme • Нуклеоплазма Біологічний процес • snRNA transcription by RNA polymerase II • mRNA 3'-end processing Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	23248	75137
Ensembl	ENSG00000163125	ENSMUSG00000028106
UniProt	Q5VT52	Q6NXI6
RefSeq (мРНК)	NM_001297673 NM_001297674 NM_015203	NM_001081293 NM_028328 NM_029180 NM_001368178 NM_001368179 NM_001368180 NM_001368181
RefSeq (білок)	NP_001284602 NP_001284603 NP_056018	NP_001074762 NP_001355107 NP_001355108 NP_001355109 NP_001355110 NP_082604
Локус (UCSC)	Хр. 1: 150.36 – 150.48 Mb	Хр. 3: 95.67 – 95.73 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

RPRD2 (англ. Regulation of nuclear pre-mRNA domain containing 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 461 амінокислот, а молекулярна маса — 156 020.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAAGGGGGSS		KASSSSASSA		GALESSLDRK		FQSVTNTMES		IQGLSSWCIE
NKKHHSTIVY		HWMKWLRRSA		YPHRLNLFYL		ANDVIQNCKR		KNAIIFRESF
ADVLPEAAAL		VKDPSVSKSV		ERIFKIWEDR		NVYPEEMIVA		LREALSTTFK
TQKQLKENLN		KQPNKQWKKS		QTSTNPKAAL		KSKIVAEFRS		QALIEELLLY
KRSEDQIELK		EKQLSTMRVD		VCSTETLKCL		KDKTGGKKFS		KEFEEASSKL
EEFVNGLDKQ		VKNGPSLTEA		LENAGIFYEA		QYKEVKVVAN		AYKTFANRVN
NLKKKLDQLK		STLPDPEESP		VPSPSMDAPS		PTGSESPFQG		MGGEESQSPT
MESEKSATPE		PVTDNRDVED		MELSDVEDDG		SKIIVEDRKE		KPAEKSAVST
SVPTKPTENI		SKASSCTPVP		VTMTATPPLP		KPVNTSLSPS		PALALPNLAN
VDLAKISSIL		SSLTSVMKNT		GVSPASRPSP		GTPTSPSNLT		SGLKTPAPAT
TTSHNPLANI		LSKVEITPES		ILSALSKTQT		QSAPALQGLS		SLLQSVTGNP
VPASEAASQS		TSASPANTTV		STIKGRNLPS		SAQPFIPKSF		NYSPNSSTSE
VSSTSASKAS		IGQSPGLPST		TFKLPSNSLG		FTATHNTSPA		APPTEVTICQ
SSEVSKPKLE		SESTSPSLEM		KIHNFLKGNP		GFSGLNLNIP		ILSSLGSSAP
SESHPSDFQR		GPTSTSIDNI		DGTPVRDERS		GTPTQDEMMD		KPTSSSVDTM
SLLSKIISPG		SSTPSSTRSP		PPGRDESYPR		ELSNSVSTYR		PFGLGSESPY
KQPSDGMERP		SSLMDSSQEK		FYPDTSFQED		EDYRDFEYSG		PPPSAMMNLE
KKPAKSILKS		SKLSDTTEYQ		PILSSYSHRA		QEFGVKSAFP		PSVRALLDSS
ENCDRLSSSP		GLFGAFSVRG		NEPGSDRSPS		PSKNDSFFTP		DSNHNSLSQS
TTGHLSLPQK		QYPDSPHPVP		HRSLFSPQNT		LAAPTGHPPT		SGVEKVLAST
ISTTSTIEFK		NMLKNASRKP		SDDKHFGQAP		SKGTPSDGVS		LSNLTQPSLT
ATDQQQQEEH		YRIETRVSSS		CLDLPDSTEE		KGAPIETLGY		HSASNRRMSG
EPIQTVESIR		VPGKGNRGHG		REASRVGWFD		LSTSGSSFDN		GPSSASELAS
LGGGGSGGLT		GFKTAPYKER		APQFQESVGS		FRSNSFNSTF		EHHLPPSPLE
HGTPFQREPV		GPSSAPPVPP		KDHGGIFSRD		APTHLPSVDL		SNPFTKEAAL
AHAAPPPPPG		EHSGIPFPTP		PPPPPPGEHS		SSGGSGVPFS		TPPPPPPPVD
HSGVVPFPAP		PLAEHGVAGA		VAVFPKDHSS		LLQGTLAEHF		GVLPGPRDHG
GPTQRDLNGP		GLSRVRESLT		LPSHSLEHLG		PPHGGGGGGG		SNSSSGPPLG
PSHRDTISRS		GIILRSPRPD		FRPREPFLSR		DPFHSLKRPR		PPFARGPPFF
APKRPFFPPR		Y

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як поліморфізм, альтернативний сплайсинг.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
• Carrascal M., Ovelleiro D., Casas V., Gay M., Abian J. (2008). Phosphorylation analysis of primary human T lymphocytes using sequential IMAC and titanium oxide enrichment. J. Proteome Res. 7: 5167—5176. PMID 19367720 DOI:10.1021/pr800500r

Див. також

• Хромосома 1