RRP9

RRP9
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4J0W, 4JXM
Ідентифікатори
Символи	RRP9, RNU3IP2, U3-55K, ribosomal RNA processing 9, small subunit (SSU) processome component, homolog (yeast), ribosomal RNA processing 9, U3 small nucleolar RNA binding protein
Зовнішні ІД	MGI: 2384313 HomoloGene: 3452 GeneCards: RRP9
Реагує на сполуку
Viroporin 3a
Онтологія гена Молекулярна функція • U3 snoRNA binding • RNA binding • snoRNA binding Клітинна компонента • small-subunit processome • ядерце • box C/D RNP complex • нуклеоплазма • клітинне ядро Біологічний процес • rRNA processing Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	9136	27966
Ensembl	ENSG00000114767	ENSMUSG00000041506
UniProt	O43818	Q91WM3
RefSeq (мРНК)	NM_004704	NM_145620
RefSeq (білок)	NP_004695	NP_663595
Локус (UCSC)	Хр. 3: 51.93 – 51.94 Mb	Хр. 9: 106.35 – 106.36 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

RRP9 (англ. Ribosomal RNA processing 9, U3 small nucleolar RNA binding protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 475 амінокислот, а молекулярна маса — 51 841.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSATAAARKR		GKPASGAGAG		AGAGKRRRKA		DSAGDRGKSK		GGGKMNEEIS
SDSESESLAP		RKPEEEEEEE		LEETAQEKKL		RLAKLYLEQL		RQQEEEKAEA
RAFEEDQVAG		RLKEDVLEQR		GRLQKLVAKE		IQAPASADIR		VLRGHQLSIT
CLVVTPDDSA		IFSAAKDCSI		IKWSVESGRK		LHVIPRAKKG		AEGKPPGHSS
HVLCMAISSD		GKYLASGDRS		KLILIWEAQS		CQHLYTFTGH		RDAVSGLAFR
RGTHQLYSTS		HDRSVKVWNV		AENSYVETLF		GHQDAVAALD		ALSRECCVTA
GGRDGTVRVW		KIPEESQLVF		YGHQGSIDCI		HLINEEHMVS		GADDGSVALW
GLSKKRPLAL		QREAHGLRGE		PGLEQPFWIS		SVAALLNTDL		VATGSHSSCV
RLWQCGEGFR		QLDLLCDIPL		VGFINSLKFS		SSGDFLVAGV		GQEHRLGRWW
RIKEARNSVC		IIPLRRVPVP		PAAGS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рибонуклеопротеїнів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як процесинг рРНК, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Pluk H., Soffner J., Luehrmann R., van Venrooij W.J. (1998). cDNA cloning and characterization of the human U3 small nucleolar ribonucleoprotein complex-associated 55-kilodalton protein. Mol. Cell. Biol. 18: 488—498. PMID 9418896 DOI:10.1128/MCB.18.1.488
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 3