RTN1

RTN1
Ідентифікатори
Символи	RTN1, NSP, reticulon 1
Зовнішні ІД	OMIM: 600865 MGI: 1933947 HomoloGene: 49654 GeneCards: RTN1
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • integral component of membrane • integral component of endoplasmic reticulum membrane • endoplasmic reticulum membrane • мембрана • ендоплазматичний ретикулум • Golgi membrane • комплекс Ґольджі Біологічний процес • neuron differentiation Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	6252	104001
Ensembl	ENSG00000139970	ENSMUSG00000021087
UniProt	Q16799	Q8K0T0
RefSeq (мРНК)	NM_001243115 NM_021136 NM_206852 NM_206857 NM_001363702	NM_001007596 NM_001286448 NM_153457
RefSeq (білок)	NP_066959 NP_996734 NP_001350631	NP_001007597 NP_001273377 NP_703187
Локус (UCSC)	Хр. 14: 59.6 – 59.87 Mb	Хр. 12: 72.26 – 72.46 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

RTN1 (англ. Reticulon 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 14-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 776 амінокислот, а молекулярна маса — 83 618.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAAPGDPQDE		LLPLAGPGSQ		WLRHRGEGEN		EAVTPKGATP		APQAGEPSPG
LGARAREAAS		REAGSGPARQ		SPVAMETAST		GVAGVSSAMD		HTFSTTSKDG
EGSCYTSLIS		DICYPPQEDS		TYFTGILQKE		NGHVTISESP		EELGTPGPSL
PDVPGIESRG		LFSSDSGIEM		TPAESTEVNK		ILADPLDQMK		AEAYKYIDIT
RPEEVKHQEQ		HHPELEDKDL		DFKNKDTDIS		IKPEGVREPD		KPAPVEGKII
KDHLLEESTF		APYIDDLSEE		QRRAPQITTP		VKITLTEIEP		SVETTTQEKT
PEKQDICLKP		SPDTVPTVTV		SEPEDDSPGS		ITPPSSGTEP		SAAESQGKGS
ISEDELITAI		KEAKGLSYET		AENPRPVGQL		ADRPEVKARS		GPPTIPSPLD
HEASSAESGD		SEIELVSEDP		MAAEDALPSG		YVSFGHVGGP		PPSPASPSIQ
YSILREEREA		ELDSELIIES		CDASSASEES		PKREQDSPPM		KPSALDAIRE
ETGVRAEERA		PSRRGLAEPG		SFLDYPSTEP		QPGPELPPGD		GALEPETPML
PRKPEEDSSS		NQSPAATKGP		GPLGPGAPPP		LLFLNKQKAI		DLLYWRDIKQ
TGIVFGSFLL		LLFSLTQFSV		VSVVAYLALA		ALSATISFRI		YKSVLQAVQK
TDEGHPFKAY		LELEITLSQE		QIQKYTDCLQ		FYVNSTLKEL		RRLFLVQDLV
DSLKFAVLMW		LLTYVGALFN		GLTLLLMAVV		SMFTLPVVYV		KHQAQIDQYL
GLVRTHINAV		VAKIQAKIPG		AKRHAE

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані, ендоплазматичному ретикулумі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Urade T., Yamamoto Y., Zhang X., Ku Y., Sakisaka T. (2014). Identification and characterization of TMEM33 as a reticulon-binding protein. Kobe J. Med. Sci. 60: E57—E65. PMID 25612671

Див. також

• Хромосома 14