SCAMP1

SCAMP1
Ідентифікатори
Символи	SCAMP1, SCAMP, SCAMP37, secretory carrier membrane protein 1
Зовнішні ІД	OMIM: 606911 MGI: 1349480 HomoloGene: 37975 GeneCards: SCAMP1
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • мембрана • integral component of membrane • ендосома • recycling endosome membrane • trans-Golgi network • комплекс Ґольджі • синапс • synaptic vesicle membrane • zymogen granule membrane • clathrin-coated vesicle • клітинна мембрана • specific granule membrane • cytoplasmic vesicle membrane • Golgi membrane • trans-Golgi network membrane Біологічний процес • protein transport • post-Golgi vesicle-mediated transport • екзоцитоз • neutrophil degranulation Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	9522	107767
Ensembl	ENSG00000085365	ENSMUSG00000021687
UniProt	O15126	Q8K021
RefSeq (мРНК)	NM_001290229 NM_004866 NM_052822	NM_029153 NM_001346609
RefSeq (білок)	NP_001277158 NP_004857	NP_001333538 NP_083429
Локус (UCSC)	Хр. 5: 78.36 – 78.48 Mb	Хр. 13: 94.34 – 94.42 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SCAMP1 (англ. Secretory carrier membrane protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 338 амінокислот, а молекулярна маса — 37 920.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSDFDSNPFA		DPDLNNPFKD		PSVTQVTRNV		PPGLDEYNPF		SDSRTPPPGG
VKMPNVPNTQ		PAIMKPTEEH		PAYTQIAKEH		ALAQAELLKR		QEELERKAAE
LDRREREMQN		LSQHGRKNNW		PPLPSNFPVG		PCFYQDFSVD		IPVEFQKTVK
LMYYLWMFHA		VTLFLNIFGC		LAWFCVDSAR		AVDFGLSILW		FLLFTPCSFV
CWYRPLYGAF		RSDSSFRFFV		FFFVYICQFA		VHVLQAAGFH		NWGNCGWISS
LTGLNQNIPV		GIMMIIIAAL		FTASAVISLV		MFKKVHGLYR		TTGASFEKAQ
QEFATGVMSN		KTVQTAAANA		ASTAASSAAQ		NAFKGNQI

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані, апараті гольджі, ендосомах.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Hillman R.T., Green R.E., Brenner S.E. (2004). An unappreciated role for RNA surveillance. Genome Biol. 5: R8.1—R8.16. PMID 14759258 DOI:10.1186/gb-2004-5-2-r8
• Singleton D.R., Wu T.T., Castle J.D. (1997). Three mammalian SCAMPs (secretory carrier membrane proteins) are highly related products of distinct genes having similar subcellular distributions. J. Cell Sci. 110: 2099—2107. PMID 9378760

Див. також

• Хромосома 5