SCG3

SCG3
Ідентифікатори
Символи	SCG3, SGIII, secretogranin III
Зовнішні ІД	OMIM: 611796 MGI: 103032 HomoloGene: 7526 GeneCards: SCG3
Онтологія гена Молекулярна функція • RNA binding Клітинна компонента • extracellular region • secretory granule lumen • transport vesicle membrane • мембрана • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • endoplasmic reticulum lumen • secretory granule membrane • transport vesicle Біологічний процес • platelet degranulation • посттрансляційна модифікація • protein localization to secretory granule Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	29106	20255
Ensembl	ENSG00000104112	ENSMUSG00000032181
UniProt	Q8WXD2	P47867
RefSeq (мРНК)	NM_013243 NM_001165257	NM_001164790 NM_009130
RefSeq (білок)	NP_001158729 NP_037375	NP_001158262 NP_033156
Локус (UCSC)	Хр. 15: 51.68 – 51.72 Mb	Хр. 9: 75.55 – 75.59 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SCG3 (англ. Secretogranin III) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 15-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 468 амінокислот, а молекулярна маса — 53 005.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGFLGTGTWI		LVLVLPIQAF		PKPGGSQDKS		LHNRELSAER		PLNEQIAEAE
EDKIKKTYPP		ENKPGQSNYS		FVDNLNLLKA		ITEKEKIEKE		RQSIRSSPLD
NKLNVEDVDS		TKNRKLIDDY		DSTKSGLDHK		FQDDPDGLHQ		LDGTPLTAED
IVHKIAARIY		EENDRAVFDK		IVSKLLNLGL		ITESQAHTLE		DEVAEVLQKL
ISKEANNYEE		DPNKPTSWTE		NQAGKIPEKV		TPMAAIQDGL		AKGENDETVS
NTLTLTNGLE		RRTKTYSEDN		FEELQYFPNF		YALLKSIDSE		KEAKEKETLI
TIMKTLIDFV		KMMVKYGTIS		PEEGVSYLEN		LDEMIALQTK		NKLEKNATDN
ISKLFPAPSE		KSHEETDSTK		EEAAKMEKEY		GSLKDSTKDD		NSNPGGKTDE
PKGKTEAYLE		AIRKNIEWLK		KHDKKGNKED		YDLSKMRDFI		NKQADAYVEK
GILDKEEAEA		IKRIYSSL

A: Аланін
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані, цитоплазматичних везикулах. Також секретований назовні.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Halim A., Ruetschi U., Larson G., Nilsson J. (2013). LC-MS/MS characterization of O-glycosylation sites and glycan structures of human cerebrospinal fluid glycoproteins. J. Proteome Res. 12: 573—584. PMID 23234360 DOI:10.1021/pr300963h

Див. також

• Хромосома 15