SCP2

SCP2
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1QND, 2C0L
Ідентифікатори
Символи	SCP2, NLTP, NSL-TP, SCP-2, SCP-CHI, SCP-X, SCPX, sterol carrier protein 2, SCOX
Зовнішні ІД	OMIM: 184755 MGI: 98254 HomoloGene: 37717 GeneCards: SCP2
Онтологія гена Молекулярна функція • transferase activity • phosphatidylinositol transfer activity • fatty-acyl-CoA binding • acyltransferase activity, transferring groups other than amino-acyl groups • sterol transporter activity • oleic acid binding • long-chain fatty acyl-CoA binding • cholesterol binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • propanoyl-CoA C-acyltransferase activity • каталітична активність • signaling receptor binding • acyltransferase activity • lipid binding • propionyl-CoA C2-trimethyltridecanoyltransferase activity Клітинна компонента • мембрана • внутрішньоклітинна мембранна органела • пероксисома • нуклеоплазма • peroxisomal matrix • мітохондрія • екзосома • цитоплазма • гіалоплазма • GO:0009327 protein-containing complex Біологічний процес • progesterone biosynthetic process • peroxisome organization • lipid transport • inositol trisphosphate biosynthetic process • alpha-linolenic acid metabolic process • positive regulation of steroid metabolic process • lipid hydroperoxide transport • positive regulation of intracellular cholesterol transport • fatty acid beta-oxidation using acyl-CoA oxidase • обмін речовин • protein localization to plasma membrane • bile acid biosynthetic process • sterol transport • steroid biosynthetic process • phospholipid transport • GO:0015915 транспорт • protein targeting to peroxisome Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	6342	20280
Ensembl	ENSG00000116171	ENSMUSG00000028603
UniProt	P22307	P32020
RefSeq (мРНК)	NM_001007098 NM_001007099 NM_001007100 NM_001007250 NM_001193599 NM_001193600 NM_001193617 NM_002979 NM_001330587	NM_011327
RefSeq (білок)	NP_001007099 NP_001007100 NP_001007101 NP_001007251 NP_001180528 NP_001180529 NP_001180546 NP_001317516 NP_002970	NP_035457
Локус (UCSC)	Хр. 1: 52.93 – 53.05 Mb	Хр. 4: 107.9 – 108 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SCP2 (англ. Sterol carrier protein 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 547 амінокислот, а молекулярна маса — 58 994.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSSSPWEPAT		LRRVFVVGVG		MTKFVKPGAE		NSRDYPDLAE		EAGKKALADA
QIPYSAVDQA		CVGYVFGDST		CGQRAIYHSL		GMTGIPIINV		NNNCATGSTA
LFMARQLIQG		GVAECVLALG		FEKMSKGSLG		IKFSDRTIPT		DKHVDLLINK
YGLSAHPVAP		QMFGYAGKEH		MEKYGTKIEH		FAKIGWKNHK		HSVNNPYSQF
QDEYSLDEVM		ASKEVFDFLT		ILQCCPTSDG		AAAAILASEA		FVQKYGLQSK
AVEILAQEMM		TDLPSSFEEK		SIIKMVGFDM		SKEAARKCYE		KSGLTPNDID
VIELHDCFST		NELLTYEALG		LCPEGQGATL		VDRGDNTYGG		KWVINPSGGL
ISKGHPLGAT		GLAQCAELCW		QLRGEAGKRQ		VPGAKVALQH		NLGIGGAVVV
TLYKMGFPEA		ASSFRTHQIE		AVPTSSASDG		FKANLVFKEI		EKKLEEEGEQ
FVKKIGGIFA		FKVKDGPGGK		EATWVVDVKN		GKGSVLPNSD		KKADCTITMA
DSDFLALMTG		KMNPQSAFFQ		GKLKITGNMG		LAMKLQNLQL		QPGNAKL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, ацилтрансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт, транспорт ліпідів, поліморфізм, ацетиляція. Білок має сайт для зв'язування з ліпідами. Локалізований у цитоплазмі, мітохондрії, пероксисомах.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Yamamoto R. (1992). Localization of human sterol carrier protein 2 gene and cDNA expression in COS-7 cell. Hokkaido Igaku Zasshi. 67: 839—848. PMID 1483685

Див. також

• Хромосома 1