SDF4

SDF4
Ідентифікатори
Символи	SDF4, Cab45, SDF-4, stromal cell derived factor 4
Зовнішні ІД	OMIM: 614282 MGI: 108079 HomoloGene: 32121 GeneCards: SDF4
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • identical protein binding • calcium ion binding Клітинна компонента • cell projection • екзосома • bleb • late endosome • Golgi lumen • цитоплазма • мембрана • клітинна мембрана • комплекс Ґольджі • ендоплазматичний ретикулум Біологічний процес • УФ-захист • zymogen granule exocytosis • response to ethanol • cerebellum development • calcium-ion regulated exocytosis • екзоцитоз • fat cell differentiation Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	51150	20318
Ensembl	ENSG00000078808	ENSMUSG00000029076
UniProt	Q9BRK5	Q61112
RefSeq (мРНК)	NM_016176 NM_016547	NM_011341 NM_001302467 NM_001302468 NM_001302469
RefSeq (білок)	NP_057260 NP_057631	NP_001289396 NP_001289397 NP_001289398 NP_035471
Локус (UCSC)	Хр. 1: 1.22 – 1.23 Mb	Хр. 4: 156.08 – 156.1 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SDF4 (англ. Stromal cell derived factor 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 362 амінокислот, а молекулярна маса — 41 807.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MVWPWVAMAS		RWGPLIGLAP		CCLWLLGAVL		LMDASARPAN		HSSTRERVAN
REENEILPPD		HLNGVKLEMD		GHLNRGFHQE		VFLGKDLGGF		DEDAEPRRSR
RKLMVIFSKV		DVNTDRKISA		KEMQRWIMEK		TAEHFQEAME		ESKTHFRAVD
PDGDGHVSWD		EYKVKFLASK		GHSEKEVADA		IRLNEELKVD		EETQEVLENL
KDRWYQADSP		PADLLLTEEE		FLSFLHPEHS		RGMLRFMVKE		IVRDLDQDGD
KQLSVPEFIS		LPVGTVENQQ		GQDIDDNWVK		DRKKEFEELI		DSNHDGIVTA
EELESYMDPM		NEYNALNEAK		QMIAVADENQ		NHHLEPEEVL		KYSEFFTGSK
LVDYARSVHE		EF

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як екзоцитоз, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, мембрані, клітинних відростках, апараті гольджі.

Література

• Koivu T., Laitinen S., Riento K., Olkkonen V.M. (1997). Sequence of a human cDNA encoding Cab45, a Ca2+-binding protein with six EF-hand motifs. DNA Seq. 7: 217—220. PMID 9254016 DOI:10.3109/10425179709034038
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 1