SDR16C5

SDR16C5
Ідентифікатори
Символи	SDR16C5, RDH#2, RDH-E2, RDHE2, EPHD-2, retSDR2, short chain dehydrogenase/reductase family 16C, member 5, short chain dehydrogenase/reductase family 16C member 5
Зовнішні ІД	OMIM: 608989 MGI: 2668443 HomoloGene: 15039 GeneCards: SDR16C5
Онтологія гена Молекулярна функція • oxidoreductase activity • NAD-retinol dehydrogenase activity • transcription factor binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001106 transcription corepressor activity Клітинна компонента • integral component of membrane • endoplasmic reticulum membrane • мембрана • Хроматин • клітинне ядро • ендоплазматичний ретикулум • клітинна мембрана • transcription repressor complex • lipid droplet Біологічний процес • retinol metabolic process • keratinocyte proliferation • retinal metabolic process • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • positive regulation of histone deacetylation • negative regulation of histone acetylation Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	195814	242285
Ensembl	н/д	ENSMUSG00000028236
UniProt	Q8N3Y7	Q7TQA3
RefSeq (мРНК)	NM_138969 NM_001318049 NM_001318050	NM_181989
RefSeq (білок)	NP_001304978 NP_001304979 NP_620419	NP_871789
Локус (UCSC)	н/д	Хр. 4: 4 – 4.02 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SDR16C5 (англ. Short chain dehydrogenase/reductase family 16C member 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 8-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 309 амінокислот, а молекулярна маса — 34 095.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSFNLQSSKK		LFIFLGKSLF		SLLEAMIFAL		LPKPRKNVAG		EIVLITGAGS
GLGRLLALQF		ARLGSVLVLW		DINKEGNEET		CKMAREAGAT		RVHAYTCDCS
QKEGVYRVAD		QVKKEVGDVS		ILINNAGIVT		GKKFLDCPDE		LMEKSFDVNF
KAHLWTYKAF		LPAMIANDHG		HLVCISSSAG		LSGVNGLADY		CASKFAAFGF
AESVFVETFV		QKQKGIKTTI		VCPFFIKTGM		FEGCTTGCPS		LLPILEPKYA
VEKIVEAILQ		EKMYLYMPKL		LYFMMFLKSF		LPLKTGLLIA		DYLGILHAMD
GFVDQKKKL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до оксидоредуктаз. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з НАД, НАДФ. Локалізований у мембрані, ендоплазматичному ретикулумі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Lee S.-A., Belyaeva O.V., Kedishvili N.Y. (2009). Biochemical characterization of human epidermal retinol dehydrogenase 2. Chem. Biol. Interact. 178: 182—187. PMID 18926804 DOI:10.1016/j.cbi.2008.09.019

Див. також

• Хромосома 8