SENP8

SENP8
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1XT9, 2BKQ, 2BKR
Ідентифікатори
Символи	SENP8, DEN1, NEDP1, PRSC2, SUMO/sentrin peptidase family member, NEDD8 specific, SUMO peptidase family member, NEDD8 specific
Зовнішні ІД	OMIM: 608659 MGI: 1918849 HomoloGene: 14084 GeneCards: SENP8
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0070122 peptidase activity • cysteine-type peptidase activity • hydrolase activity • NEDD8-specific protease activity • endopeptidase activity Клітинна компонента • гіалоплазма • клітинне ядро Біологічний процес • протеоліз • protein deubiquitination • protein desumoylation • посттрансляційна модифікація Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	123228	71599
Ensembl	ENSG00000166192	ENSMUSG00000051705
UniProt	Q96LD8	Q9D2Z4
RefSeq (мРНК)	NM_001166340 NM_001172109 NM_001172110 NM_001172111 NM_145204	NM_001172068 NM_001172069 NM_001172070 NM_001172071 NM_027838
RefSeq (білок)	NP_001159812 NP_001165580 NP_001165581 NP_001165582 NP_660205	NP_001165539 NP_001165540 NP_001165541 NP_001165542 NP_082114
Локус (UCSC)	Хр. 15: 72.11 – 72.14 Mb	Хр. 9: 59.64 – 59.66 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SENP8 (англ. SUMO/sentrin peptidase family member, NEDD8 specific) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 15-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 212 амінокислот, а молекулярна маса — 24 107.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MDPVVLSYMD		SLLRQSDVSL		LDPPSWLNDH		IIGFAFEYFA		NSQFHDCSDH
VSFISPEVTQ		FIKCTSNPAE		IAMFLEPLDL		PNKRVVFLAI		NDNSNQAAGG
THWSLLVYLQ		DKNSFFHYDS		HSRSNSVHAK		QVAEKLEAFL		GRKGDKLAFV
EEKAPAQQNS		YDCGMYVICN		TEALCQNFFR		QQTESLLQLL		TPAYITKKRG
EWKDLITTLA		KK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, тіолових протеаз. Задіяний у таких біологічних процесах, як убіквітинування білків, ацетилювання.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Xirodimas D.P., Saville M.K., Bourdon J.-C., Hay R.T., Lane D.P. (2004). Mdm2-mediated NEDD8 conjugation of p53 inhibits its transcriptional activity. Cell. 118: 83—97. PMID 15242646 DOI:10.1016/j.cell.2004.06.016

Див. також

• Хромосома 15