SFTPB

SFTPB
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1DFW, 1KMR, 1RG3, 1RG4, 1SSZ, 2DWF, 2JOU, 2M0H, 2M1T
Ідентифікатори
Символи	SFTPB, PSP-B, SFTB3, SFTP3, SMDP1, SP-B, surfactant protein B, Surfactant protein B
Зовнішні ІД	OMIM: 178640 MGI: 109516 HomoloGene: 456 GeneCards: SFTPB
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0010577 enzyme activator activity • G protein-coupled receptor binding Клітинна компонента • multivesicular body • extracellular region • clathrin-coated endocytic vesicle • лізосома • lamellar granule • endoplasmic reticulum membrane • alveolar lamellar body • multivesicular body lumen • нуклеоплазма • міжклітинний простір Біологічний процес • animal organ morphogenesis • respiratory gaseous exchange by respiratory system • sphingolipid metabolic process • lipid metabolism • GO:0048554 positive regulation of catalytic activity Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	6439	20388
Ensembl	ENSG00000168878	ENSMUSG00000056370
UniProt	P07988	P50405
RefSeq (мРНК)	NM_000542 NM_198843 NM_001367281	NM_001282071 NM_147779
RefSeq (білок)	NP_000533 NP_942140 NP_001354210	NP_001269000 NP_680088
Локус (UCSC)	Хр. 2: 85.66 – 85.67 Mb	Хр. 6: 72.28 – 72.29 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SFTPB (англ. Surfactant protein B) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 381 амінокислот, а молекулярна маса — 42 117.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAESHLLQWL		LLLLPTLCGP		GTAAWTTSSL		ACAQGPEFWC		QSLEQALQCR
ALGHCLQEVW		GHVGADDLCQ		ECEDIVHILN		KMAKEAIFQD		TMRKFLEQEC
NVLPLKLLMP		QCNQVLDDYF		PLVIDYFQNQ		TDSNGICMHL		GLCKSRQPEP
EQEPGMSDPL		PKPLRDPLPD		PLLDKLVLPV		LPGALQARPG		PHTQDLSEQQ
FPIPLPYCWL		CRALIKRIQA		MIPKGALAVA		VAQVCRVVPL		VAGGICQCLA
ERYSVILLDT		LLGRMLPQLV		CRLVLRCSMD		DSAGPRSPTG		EWLPRDSECH
LCMSVTTQAG		NSSEQAIPQA		MLQACVGSWL		DREKCKQFVE		QHTPQLLTLV
PRGWDAHTTC		QALGVCGTMS		SPLQCIHSPD		L

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі як поліморфізм. Секретований назовні.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Johansson J., Joernvall H., Curstedt T. (1992). Human surfactant polypeptide SP-B. Disulfide bridges, C-terminal end, and peptide analysis of the airway form. FEBS Lett. 301: 165—167. PMID 1568474 DOI:10.1016/0014-5793(92)81239-I
• Sarker M., Waring A.J., Walther F.J., Keough K.M., Booth V. (2007). Structure of mini-B, a functional fragment of surfactant protein B, in detergent micelles. Biochemistry. 46: 11047—11056. PMID 17845058 DOI:10.1021/bi7011756
• Haataja R., Raemet M., Marttila R., Hallman M. (2000). Surfactant proteins A and B as interactive genetic determinants of neonatal respiratory distress syndrome. Hum. Mol. Genet. 9: 2751—2760. PMID 11063734 DOI:10.1093/hmg/9.18.2751

Див. також

• Хромосома 2