SH3BP1

SH3BP1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4J9D, 4J9F
Ідентифікатори
Символи	SH3BP1, ARHGAP43, SH3 domain binding protein 1
Зовнішні ІД	OMIM: 617368 MGI: 104603 HomoloGene: 7534 GeneCards: SH3BP1
Онтологія гена Молекулярна функція • SH3 domain binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0005097, GO:0005099, GO:0005100 GTPase activator activity • semaphorin receptor binding Клітинна компонента • цитоплазма • exocyst • lamellipodium • phagocytic cup • клітинне ядро • гіалоплазма • Адгезивні контакти • bicellular tight junction • міжклітинні контакти • cell projection • cell leading edge • внутрішньоклітинний Біологічний процес • GO:0072468 сигнальна трансдукція • phagocytosis, engulfment • actin filament organization • regulation of actin filament depolymerization • regulation of actin cytoskeleton organization • cell junction assembly • regulation of blood vessel endothelial cell migration • establishment of epithelial cell apical/basal polarity • negative regulation of small GTPase mediated signal transduction • semaphorin-plexin signaling pathway • Фагоцитоз • cell migration • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity • filopodium assembly • ruffle assembly Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	23616	20401
Ensembl	ENSG00000100092	ENSMUSG00000022436
UniProt	Q9Y3L3	P55194
RefSeq (мРНК)	NM_018957 NM_001350055	NM_009164 NM_001316684 NM_001316685 NM_001316686
RefSeq (білок)	NP_061830 NP_001336984	NP_001303613 NP_001303614 NP_001303615 NP_033190
Локус (UCSC)	Хр. 22: 37.63 – 37.66 Mb	Хр. 15: 78.78 – 78.8 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SH3BP1 (англ. SH3 domain binding protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 22-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 701 амінокислот, а молекулярна маса — 75 713.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MMKRQLHRMR		QLAQTGSLGR		TPETAEFLGE		DLLQVEQRLE		PAKRAAHNIH
KRLQACLQGQ		SGADMDKRVK		KLPLMALSTT		MAESFKELDP		DSSMGKALEM
SCAIQNQLAR		ILAEFEMTLE		RDVLQPLSRL		SEEELPAILK		HKKSLQKLVS
DWNTLKSRLS		QATKNSGSSQ		GLGGSPGSHS		HTTMANKVET		LKEEEEELKR
KVEQCRDEYL		ADLYHFVTKE		DSYANYFIRL		LEIQADYHRR		SLSSLDTALA
ELRENHGQAD		HSPSMTATHF		PRVYGVSLAT		HLQELGREIA		LPIEACVMML
LSEGMKEEGL		FRLAAGASVL		KRLKQTMASD		PHSLEEFCSD		PHAVAGALKS
YLRELPEPLM		TFDLYDDWMR		AASLKEPGAR		LQALQEVCSR		LPPENLSNLR
YLMKFLARLA		EEQEVNKMTP		SNIAIVLGPN		LLWPPEKEGD		QAQLDAASVS
SIQVVGVVEA		LIQSADTLFP		GDINFNVSGL		FSAVTLQDTV		SDRLASEELP
STAVPTPATT		PAPAPAPAPA		PAPALASAAT		KERTESEVPP		RPASPKVTRS
PPETAAPVED		MARRTKRPAP		ARPTMPPPQV		SGSRSSPPAP		PLPPGSGSPG
TPQALPRRLV		GSSLRAPTVP		PPLPPTPPQP		ARRQSRRSPA		SPSPASPGPA
SPSPVSLSNP		AQVDLGAATA		EGGAPEAISG		VPTPPAIPPQ		PRPRSLASET
N

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів гтфаз, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Carrascal M., Ovelleiro D., Casas V., Gay M., Abian J. (2008). Phosphorylation analysis of primary human T lymphocytes using sequential IMAC and titanium oxide enrichment. J. Proteome Res. 7: 5167—5176. PMID 19367720 DOI:10.1021/pr800500r

Див. також

• Хромосома 22