SIDT2

SIDT2
Ідентифікатори
Символи	SIDT2, CGI-40, SID1 transmembrane family member 2
Зовнішні ІД	OMIM: 617551 MGI: 2446134 HomoloGene: 22943 GeneCards: SIDT2
Онтологія гена Молекулярна функція • RNA transmembrane transporter activity • double-stranded RNA binding • AP-2 adaptor complex binding • AP-1 adaptor complex binding • nucleic acid transmembrane transporter activity • DNA binding • RNA binding Клітинна компонента • integral component of membrane • lysosomal membrane • мембрана • лізосома • клітинна мембрана Біологічний процес • regulation of insulin secretion involved in cellular response to glucose stimulus • type B pancreatic cell development • response to glucose • type B pancreatic cell proliferation • glucose homeostasis • GO:0000767 cell morphogenesis • dsRNA transport • Деградація РНК • RNA transport Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	51092	214597
Ensembl	ENSG00000149577	ENSMUSG00000034908
UniProt	Q8NBJ9	Q8CIF6
RefSeq (мРНК)	NM_015996 NM_001040455	NM_001289668 NM_172257 NM_001359653
RefSeq (білок)	NP_001035545	NP_001276597 NP_758461 NP_001346582
Локус (UCSC)	Хр. 11: 117.18 – 117.2 Mb	Хр. 9: 45.85 – 45.87 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SIDT2 (англ. SID1 transmembrane family member 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 832 амінокислот, а молекулярна маса — 94 454.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MFALGLPFLV		LLVASVESHL		GVLGPKNVSQ		KDAEFERTYV		DEVNSELVNI
YTFNHTVTRN		RTEGVRVSVN		VLNKQKGAPL		LFVVRQKEAV		VSFQVPLILR
GMFQRKYLYQ		KVERTLCQPP		TKNESEIQFF		YVDVSTLSPV		NTTYQLRVSR
MDDFVLRTGE		QFSFNTTAAQ		PQYFKYEFPE		GVDSVIVKVT		SNKAFPCSVI
SIQDVLCPVY		DLDNNVAFIG		MYQTMTKKAA		ITVQRKDFPS		NSFYVVVVVK
TEDQACGGSL		PFYPFAEDEP		VDQGHRQKTL		SVLVSQAVTS		EAYVSGMLFC
LGIFLSFYLL		TVLLACWENW		RQKKKTLLVA		IDRACPESGH		PRVLADSFPG
SSPYEGYNYG		SFENVSGSTD		GLVDSAGTGD		LSYGYQGRSF		EPVGTRPRVD
SMSSVEEDDY		DTLTDIDSDK		NVIRTKQYLY		VADLARKDKR		VLRKKYQIYF
WNIATIAVFY		ALPVVQLVIT		YQTVVNVTGN		QDICYYNFLC		AHPLGNLSAF
NNILSNLGYI		LLGLLFLLII		LQREINHNRA		LLRNDLCALE		CGIPKHFGLF
YAMGTALMME		GLLSACYHVC		PNYTNFQFDT		SFMYMIAGLC		MLKLYQKRHP
DINASAYSAY		ACLAIVIFFS		VLGVVFGKGN		TAFWIVFSII		HIIATLLLST
QLYYMGRWKL		DSGIFRRILH		VLYTDCIRQC		SGPLYVDRMV		LLVMGNVINW
SLAAYGLIMR		PNDFASYLLA		IGICNLLLYF		AFYIIMKLRS		GERIKLIPLL
CIVCTSVVWG		FALFFFFQGL		STWQKTPAES		REHNRDCILL		DFFDDHDIWH
FLSSIAMFGS		FLVLLTLDDD		LDTVQRDKIY		VF

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані, лізосомі.

Література

• Lai C.-H., Chou C.-Y., Ch'ang L.-Y., Liu C.-S., Lin W.-C. (2000). Identification of novel human genes evolutionarily conserved in Caenorhabditis elegans by comparative proteomics. Genome Res. 10: 703—713. PMID 10810093 DOI:10.1101/gr.10.5.703
• Zhang Z., Henzel W.J. (2004). Signal peptide prediction based on analysis of experimentally verified cleavage sites. Protein Sci. 13: 2819—2824. PMID 15340161 DOI:10.1110/ps.04682504

Див. також

• Хромосома 11