SIGIRR

SIGIRR
Ідентифікатори
Символи	SIGIRR, TIR8, single immunoglobulin and toll-interleukin 1 receptor (TIR) domain, IL-1R8, single Ig and TIR domain containing
Зовнішні ІД	OMIM: 605478 MGI: 1344402 HomoloGene: 36399 GeneCards: SIGIRR
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • integral component of membrane • мембрана • клітинна мембрана Біологічний процес • negative regulation of cytokine-mediated signaling pathway • acute-phase response • negative regulation of DNA-binding transcription factor activity • GO:0072468 сигнальна трансдукція • negative regulation of lipopolysaccharide-mediated signaling pathway • cellular response to cytokine stimulus Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	59307	24058
Ensembl	ENSG00000185187	ENSMUSG00000025494
UniProt	Q6IA17	Q9JLZ8
RefSeq (мРНК)	NM_001135053 NM_001135054 NM_021805	NM_023059 NM_001355055
RefSeq (білок)	NP_001128525 NP_001128526 NP_068577	NP_075546 NP_001341984
Локус (UCSC)	Хр. 11: 0.41 – 0.42 Mb	Хр. 7: 140.67 – 140.68 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SIGIRR (англ. Single Ig and TIR domain containing) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 410 амінокислот, а молекулярна маса — 45 679.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MPGVCDRAPD		FLSPSEDQVL		RPALGSSVAL		NCTAWVVSGP		HCSLPSVQWL
KDGLPLGIGG		HYSLHEYSWV		KANLSEVLVS		SVLGVNVTST		EVYGAFTCSI
QNISFSSFTL		QRAGPTSHVA		AVLASLLVLL		ALLLAALLYV		KCRLNVLLWY
QDAYGEVEIN		DGKLYDAYVS		YSDCPEDRKF		VNFILKPQLE		RRRGYKLFLD
DRDLLPRAEP		SADLLVNLSR		CRRLIVVLSD		AFLSRAWCSH		SFREGLCRLL
ELTRRPIFIT		FEGQRRDPAH		PALRLLRQHR		HLVTLLLWRP		GSVTPSSDFW
KEVQLALPRK		VQYRPVEGDP		QTQLQDDKDP		MLILRGRVPE		GRALDSEVDP
DPEGDLGVRG		PVFGEPSAPP		HTSGVSLGES		RSSEVDVSDL		GSRNYSARTD
FYCLVSKDDM

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Thomassen E., Renshaw B.R., Sims J.E. (1999). Identification and characterization of SIGIRR, a molecule representing a novel subtype of the IL-1R superfamily. Cytokine. 11: 389—399. PMID 10346978 DOI:10.1006/cyto.1998.0452
• Qin J., Qian Y., Yao J., Grace C., Li X. (2005). SIGIRR inhibits interleukin-1 receptor- and toll-like receptor 4-mediated signaling through different mechanisms. J. Biol. Chem. 280: 25233—25241. PMID 15866876 DOI:10.1074/jbc.M501363200

Див. також

• Хромосома 11