SKA1

SKA1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4AJ5, 4C9Y, 4CA0
Ідентифікатори
Символи	SKA1, C18orf24, spindle and kinetochore associated complex subunit 1
Зовнішні ІД	OMIM: 616673 MGI: 1913718 HomoloGene: 11975 GeneCards: SKA1
Онтологія гена Молекулярна функція • microtubule binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • хромосома • цитоплазма • гіалоплазма • веретено поділу • spindle microtubule • центромера • цитоскелет • мікротрубочка • кінетохор • outer kinetochore • microtubule cytoskeleton • mitotic spindle Біологічний процес • поділ клітини • клітинний цикл • regulation of microtubule polymerization or depolymerization • chromosome segregation • GO:0007067 мітоз Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	220134	66468
Ensembl	ENSG00000262634 ENSG00000154839	ENSMUSG00000036223
UniProt	Q96BD8	Q9CPV1
RefSeq (мРНК)	NM_145060 NM_001039535	NM_001164355 NM_025581
RefSeq (білок)	NP_001034624 NP_659497	NP_001157827 NP_079857
Локус (UCSC)	Хр. 18: 50.38 – 50.39 Mb	Хр. 18: 74.33 – 74.34 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SKA1 (англ. Spindle and kinetochore associated complex subunit 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на довгому плечі 18-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 255 амінокислот, а молекулярна маса — 29 484.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MASSDLEQLC		SHVNEKIGNI		KKTLSLRNCG		QEPTLKTVLN		KIGDEIIVIN
ELLNKLELEI		QYQEQTNNSL		KELCESLEED		YKDIEHLKEN		VPSHLPQVTV
TQSCVKGSDL		DPEEPIKVEE		PEPVKKPPKE		QRSIKEMPFI		TCDEFNGVPS
YMKSRLTYNQ		INDVIKEINK		AVISKYKILH		QPKKSMNSVT		RNLYHRFIDE
ETKDTKGRYF		IVEADIKEFT		TLKADKKFHV		LLNILRHCRR		LSEVRGGGLT
RYVIT

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинний цикл, поділ клітини, мітоз, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, хромосомах, центромерах, кінетохорі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Hanisch A., Sillje H.H.W., Nigg E.A. (2006). Timely anaphase onset requires a novel spindle and kinetochore complex comprising Ska1 and Ska2. EMBO J. 25: 5504—5515. PMID 17093495 DOI:10.1038/sj.emboj.7601426

Див. також

• Хромосома 18