SLC24A1

SLC24A1
Ідентифікатори
Символи	SLC24A1, CSNB1D, HsT17412, NCKX, NCKX1, RODX, solute carrier family 24 member 1
Зовнішні ІД	OMIM: 603617 MGI: 2384871 HomoloGene: 3472 GeneCards: SLC24A1
Пов'язані генетичні захворювання
congenital stationary night blindness 1D
Онтологія гена Молекулярна функція • calcium ion binding • calcium channel activity • potassium ion binding • sodium ion binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • antiporter activity • symporter activity • calcium, potassium:sodium antiporter activity Клітинна компонента • integral component of membrane • мембрана • outer membrane • клітинна мембрана • integral component of plasma membrane Біологічний процес • відповідь на стимул • cellular calcium ion homeostasis • ion transport • response to light intensity • calcium ion transport • зір • sodium ion transmembrane transport • трансмембранний транспорт • calcium ion transmembrane transport • довготривала потенціація • Довготривале пригнічення • potassium ion transmembrane transport • anion transmembrane transport Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	9187	214111
Ensembl	ENSG00000074621	ENSMUSG00000034452
UniProt	O60721	Q91WD8
RefSeq (мРНК)	NM_001254740 NM_001301031 NM_001301032 NM_001301033 NM_004727	NM_144813
RefSeq (білок)	NP_001241669 NP_001287960 NP_001287961 NP_001287962 NP_004718	NP_659062
Локус (UCSC)	Хр. 15: 65.61 – 65.66 Mb	Хр. 9: 64.83 – 64.86 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SLC24A1 (англ. Solute carrier family 24 member 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 15-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 099 амінокислот, а молекулярна маса — 121 374.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGKLIRMGPQ		ERWLLRTKRL		HWSRLLFLLG		MLIIGSTYQH		LRRPRGLSSL
WAAVSSHQPI		KLASRDLSSE		EMMMMSSSPS		KPSSEMGGKM		LVPQASVGSD
EATLSMTVEN		IPSMPKRTAK		MIPTTTKNNY		SPTAAGTERR		KEDTPTSSRT
LTYYTSTSSR		QIVKKYTPTP		RGEMKSYSPT		QVREKVKYTP		SPRGRRVGTY
VPSTFMTMET		SHAITPRTTV		KDSDITATYK		ILETNSLKRI		MEETTPTTLK
GMFDSTPTFL		THEVEANVLT		SPRSVMEKNN		LFPPRRVESN		SSAHPWGLVG
KSNPKTPQGT		VLLHTPATSE		GQVTISTMTG		SSPAETKAFT		AAWSLRNPSP
RTSVSAIKTA		PAIVWRLAKK		PSTAPSTSTT		PTVRAKLTMQ		VHHCVVVKPT
PAMLTTPSPS		LTTALLPEEL		SPSPSVLPPS		LPDLHPKGEY		PPDLFSVEER
RQGWVVLHVF		GMMYVFVALA		IVCDEYFVPA		LGVITDKLQI		SEDVAGATFM
AAGGSAPELF		TSLIGVFISH		SNVGIGTIVG		SAVFNILFVI		GTCSLFSREI
LNLTWWPLFR		DVSFYILDLI		MLILFFLDSL		IAWWESLLLL		LAYAFYVFTM
KWNKHIEVWV		KEQLSRRPVA		KVMALEDLSK		PGDGAIAVDE		LQDNKKLKLP
SLLTRGSSST		SLHNSTIRST		IYQLMLHSLD		PLREVRLAKE		KEEESLNQGA
RAQPQAKAES		KPEEEEPAKL		PAVTVTPAPV		PDIKGDQKEN		PGGQEDVAEA
ESTGEMPGEE		GETAGEGETE		EKSGGETQPE		GEGETETQGK		GEECEDENEA
EGKGDNEGED		EGEIHAEDGE		MKGNEGETES		QELSAENHGE		AKNDEKGVED
GGGSDGGDSE		EEEEEEEEQE		EEEEEEEQEE		EEEEEEEEEE		KGNEEPLSLD
WPETRQKQAI		YLFLLPIVFP		LWLTVPDVRR		QESRKFFVFT		FLGSIMWIAM
FSYLMVWWAH		QVGETIGISE		EIMGLTILAA		GTSIPDLITS		VIVARKGLGD
MAVSSSVGSN		IFDITVGLPV		PWLLFSLING		LQPVPVSSNG		LFCAIVLLFL
MLLFVISSIA		SCKWRMNKIL		GFTMFLLYFV		FLIISVMLED		RIISCPVSV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт іонів, транспорт, симпортний транспорт, транспорт кальцію, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію. Локалізований у мембрані.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• McKiernan C.J., Friedlander M. (1999). The retinal rod Na(+)/Ca(2+),K(+) exchanger contains a noncleaved signal sequence required for translocation of the N-terminus. J. Biol. Chem. 274: 38177—38182. PMID 10608890 DOI:10.1074/jbc.274.53.38177
• Tucker J.E., Winkfein R.J., Cooper C.B., Schnetkamp P.P.M. (1998). cDNA cloning of the human retinal rod Na-Ca + K exchanger: comparison with a revised bovine sequence. Invest. Ophthalmol. Vis. Sci. 39: 435—440. PMID 9478004

Див. також

• Хромосома 15