SLC39A6

SLC39A6
Ідентифікатори
Символи	SLC39A6, LIV-1, ZIP6, solute carrier family 39 member 6, LIV1
Зовнішні ІД	OMIM: 608731 MGI: 2147279 HomoloGene: 8199 GeneCards: SLC39A6
Онтологія гена Молекулярна функція • metal ion transmembrane transporter activity • zinc ion transmembrane transporter activity Клітинна компонента • integral component of membrane • cell surface • клітинна мембрана • integral component of plasma membrane • lamellipodium membrane • ендоплазматичний ретикулум • мембрана Біологічний процес • GO:0070839 metal ion transport • zinc ion transmembrane transport • zinc ion transport • zinc ion import across plasma membrane • ion transport • cellular zinc ion homeostasis • трансмембранний транспорт • GO:0015915 транспорт Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	25800	106957
Ensembl	ENSG00000141424	ENSMUSG00000024270
UniProt	Q13433	Q8C145
RefSeq (мРНК)	NM_001099406 NM_012319	NM_139143
RefSeq (білок)	NP_001092876 NP_036451	NP_631882
Локус (UCSC)	Хр. 18: 36.11 – 36.13 Mb	Хр. 18: 24.71 – 24.74 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SLC39A6 (англ. Solute carrier family 39 member 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 18-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 755 амінокислот, а молекулярна маса — 85 047.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MARKLSVILI		LTFALSVTNP		LHELKAAAFP		QTTEKISPNW		ESGINVDLAI
STRQYHLQQL		FYRYGENNSL		SVEGFRKLLQ		NIGIDKIKRI		HIHHDHDHHS
DHEHHSDHER		HSDHEHHSEH		EHHSDHDHHS		HHNHAASGKN		KRKALCPDHD
SDSSGKDPRN		SQGKGAHRPE		HASGRRNVKD		SVSASEVTST		VYNTVSEGTH
FLETIETPRP		GKLFPKDVSS		STPPSVTSKS		RVSRLAGRKT		NESVSEPRKG
FMYSRNTNEN		PQECFNASKL		LTSHGMGIQV		PLNATEFNYL		CPAIINQIDA
RSCLIHTSEK		KAEIPPKTYS		LQIAWVGGFI		AISIISFLSL		LGVILVPLMN
RVFFKFLLSF		LVALAVGTLS		GDAFLHLLPH		SHASHHHSHS		HEEPAMEMKR
GPLFSHLSSQ		NIEESAYFDS		TWKGLTALGG		LYFMFLVEHV		LTLIKQFKDK
KKKNQKKPEN		DDDVEIKKQL		SKYESQLSTN		EEKVDTDDRT		EGYLRADSQE
PSHFDSQQPA		VLEEEEVMIA		HAHPQEVYNE		YVPRGCKNKC		HSHFHDTLGQ
SDDLIHHHHD		YHHILHHHHH		QNHHPHSHSQ		RYSREELKDA		GVATLAWMVI
MGDGLHNFSD		GLAIGAAFTE		GLSSGLSTSV		AVFCHELPHE		LGDFAVLLKA
GMTVKQAVLY		NALSAMLAYL		GMATGIFIGH		YAENVSMWIF		ALTAGLFMYV
ALVDMVPEML		HNDASDHGCS		RWGYFFLQNA		GMLLGFGIML		LISIFEHKIV
FRINF

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт іонів, транспорт, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іоном цинку. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Zhang Z., Henzel W.J. (2004). Signal peptide prediction based on analysis of experimentally verified cleavage sites. Protein Sci. 13: 2819—2824. PMID 15340161 DOI:10.1110/ps.04682504
• Manning D.L., Daly R.J., Lord P.G., Kelly K.F., Green C.D. (1988). Effects of oestrogen on the expression of a 4.4 kb mRNA in the ZR-75-1 human breast cancer cell line. Mol. Cell. Endocrinol. 59: 205—212. PMID 2903103 DOI:10.1016/0303-7207(88)90105-0
• Taylor K.M., Morgan H.E., Johnson A., Hadley L.J., Nicholson R.I. (2003). Structure-function analysis of LIV-1, the breast cancer-associated protein that belongs to a new subfamily of zinc transporters. Biochem. J. 375: 51—59. PMID 12839489 DOI:10.1042/BJ20030478

Див. також

• Хромосома 18