SLC6A20

SLC6A20
Ідентифікатори
Символи	SLC6A20, SIT1, XT3, Xtrp3, solute carrier family 6 member 20, IMINO
Зовнішні ІД	OMIM: 605616 MGI: 2143217 HomoloGene: 10625 GeneCards: SLC6A20
Пов'язані генетичні захворювання
натуральна віспа, glycinuria
Онтологія гена Молекулярна функція • neurotransmitter:sodium symporter activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • symporter activity • amino acid transmembrane transporter activity • L-proline transmembrane transporter activity Клітинна компонента • integral component of membrane • клітинна мембрана • integral component of plasma membrane • apical plasma membrane • мембрана • brush border membrane Біологічний процес • neurotransmitter transport • amino acid transport • glycine transport • proline transport • amino acid transmembrane transport • трансмембранний транспорт • proline transmembrane transport Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	54716	102680
Ensembl	ENSG00000163817	ENSMUSG00000036814
UniProt	Q9NP91	Q8VDB9
RefSeq (мРНК)	NM_020208 NM_022405 NM_001385683	NM_139142
RefSeq (білок)	NP_064593 NP_071800	NP_631881
Локус (UCSC)	Хр. 3: 45.76 – 45.8 Mb	Хр. 9: 123.46 – 123.51 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SLC6A20 (англ. Solute carrier family 6 member 20) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 592 амінокислот, а молекулярна маса — 65 914.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MEKARPLWAN		SLQFVFACIS		YAVGLGNVWR		FPYLCQMYGG		GSFLVPYIIM
LIVEGMPLLY		LELAVGQRMR		QGSIGAWRTI		SPYLSGVGVA		SVVVSFFLSM
YYNVINAWAF		WYLFHSFQDP		LPWSVCPLNG		NHTGYDEECE		KASSTQYFWY
RKTLNISPSL		QENGGVQWEP		ALCLLLAWLV		VYLCILRGTE		STGKVVYFTA
SLPYCVLIIY		LIRGLTLHGA		TNGLMYMFTP		KIEQLANPKA		WINAATQIFF
SLGLGFGSLI		AFASYNEPSN		NCQKHAIIVS		LINSFTSIFA		SIVTFSIYGF
KATFNYENCL		KKVSLLLTNT		FDLEDGFLTA		SNLEQVKGYL		ASAYPSKYSE
MFPQIKNCSL		ESELDTAVQG		TGLAFIVYTE		AIKNMEVSQL		WSVLYFFMLL
MLGIGSMLGN		TAAILTPLTD		SKIISSHLPK		EAISGLVCLV		NCAIGMVFTM
EAGNYWFDIF		NDYAATLSLL		LIVLVETIAV		CYVYGLRRFE		SDLKAMTGRA
VSWYWKVMWA		GVSPLLIVSL		FVFYLSDYIL		TGTLKYQAWD		ASQGQLVTKD
YPAYALAVIG		LLVASSTMCI		PLAALGTFVQ		RRLKRGDADP		VA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт, транспорт амінокислот, симпортний транспорт, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Takanaga H., Mackenzie B., Suzuki Y., Hediger M.A. (2005). Identification of mammalian proline transporter SIT1 (SLC6A20) with characteristics of classical system imino. J. Biol. Chem. 280: 8974—8984. PMID 15632147 DOI:10.1074/jbc.M413027200

Див. також

• Хромосома 3