SLITRK5

SLITRK5
Ідентифікатори
Символи	SLITRK5, LRRC11, bA364G4.2, SLIT and NTRK like family member 5
Зовнішні ІД	OMIM: 609680 MGI: 2679448 HomoloGene: 9193 GeneCards: SLITRK5
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	26050	75409
Ensembl	ENSG00000165300	ENSMUSG00000033214
UniProt	O94991	Q810B7
RefSeq (мРНК)	NM_015567 NM_001384609 NM_001384610	NM_029273 NM_198865 NM_001378768 NM_001378769 NM_001378770
RefSeq (білок)	NP_056382	NP_942565 NP_001365697 NP_001365698 NP_001365699
Локус (UCSC)	Хр. 13: 87.67 – 87.7 Mb	Хр. 14: 111.91 – 111.92 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SLITRK5 (англ. SLIT and NTRK like family member 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 13-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 958 амінокислот, а молекулярна маса — 107 486.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MHTCCPPVTL		EQDLHRKMHS		WMLQTLAFAV		TSLVLSCAET		IDYYGEICDN
ACPCEEKDGI		LTVSCENRGI		ISLSEISPPR		FPIYHLLLSG		NLLNRLYPNE
FVNYTGASIL		HLGSNVIQDI		ETGAFHGLRG		LRRLHLNNNK		LELLRDDTFL
GLENLEYLQV		DYNYISVIEP		NAFGKLHLLQ		VLILNDNLLS		SLPNNLFRFV
PLTHLDLRGN		RLKLLPYVGL		LQHMDKVVEL		QLEENPWNCS		CELISLKDWL
DSISYSALVG		DVVCETPFRL		HGRDLDEVSK		QELCPRRLIS		DYEMRPQTPL
STTGYLHTTP		ASVNSVATSS		SAVYKPPLKP		PKGTRQPNKP		RVRPTSRQPS
KDLGYSNYGP		SIAYQTKSPV		PLECPTACSC		NLQISDLGLN		VNCQERKIES
IAELQPKPYN		PKKMYLTENY		IAVVRRTDFL		EATGLDLLHL		GNNRISMIQD
RAFGDLTNLR		RLYLNGNRIE		RLSPELFYGL		QSLQYLFLQY		NLIREIQSGT
FDPVPNLQLL		FLNNNLLQAM		PSGVFSGLTL		LRLNLRSNHF		TSLPVSGVLD
QLKSLIQIDL		HDNPWDCTCD		IVGMKLWVEQ		LKVGVLVDEV		ICKAPKKFAE
TDMRSIKSEL		LCPDYSDVVV		STPTPSSIQV		PARTSAVTPA		VRLNSTGAPA
SLGAGGGASS		VPLSVLILSL		LLVFIMSVFV		AAGLFVLVMK		RRKKNQSDHT
STNNSDVSSF		NMQYSVYGGG		GGTGGHPHAH		VHHRGPALPK		VKTPAGHVYE
YIPHPLGHMC		KNPIYRSREG		NSVEDYKDLH		ELKVTYSSNH		HLQQQQQPPP
PPQQPQQQPP		PQLQLQPGEE		ERRESHHLRS		PAYSVSTIEP		REDLLSPVQD
ADRFYRGILE		PDKHCSTTPA		GNSLPEYPKF		PCSPAAYTFS		PNYDLRRPHQ
YLHPGAGDSR		LREPVLYSPP		SAVFVEPNRN		EYLELKAKLN		VEPDYLEVLE
KQTTFSQF

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Aruga J., Yokota N., Mikoshiba K. (2003). Human SLITRK family genes: genomic organization and expression profiling in normal brain and brain tumor tissue. Gene. 315: 87—94. PMID 14557068 DOI:10.1016/S0378-1119(03)00715-7

Див. також

• Хромосома 13