SMAP1

SMAP1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2CRR
Ідентифікатори
Символи	SMAP1, SMAP-1, small ArfGAP 1
Зовнішні ІД	OMIM: 611372 MGI: 2138261 HomoloGene: 134676 GeneCards: SMAP1
Онтологія гена Молекулярна функція • clathrin binding • зв'язування з іоном металу • GO:0005097, GO:0005099, GO:0005100 GTPase activator activity Клітинна компонента • цитоплазма • клітинна мембрана • мембрана Біологічний процес • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity • regulation of clathrin-dependent endocytosis • positive regulation of erythrocyte differentiation Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	60682	98366
Ensembl	ENSG00000112305	ENSMUSG00000026155
UniProt	Q8IYB5	Q91VZ6
RefSeq (мРНК)	NM_001044305 NM_001281439 NM_001281440 NM_021940	NM_001290683 NM_028534 NM_001357395
RefSeq (білок)	NP_001037770 NP_001268368 NP_001268369 NP_068759	NP_001277612 NP_082810 NP_001344324
Локус (UCSC)	Хр. 6: 70.67 – 70.86 Mb	Хр. 1: 23.88 – 23.96 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SMAP1 (англ. Small ArfGAP 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 467 амінокислот, а молекулярна маса — 50 386.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MATRSCREKA		QKLNEQHQLI		LSKLLREEDN		KYCADCEAKG		PRWASWNIGV
FICIRCAGIH		RNLGVHISRV		KSVNLDQWTA		EQIQCMQDMG		NTKARLLYEA
NLPENFRRPQ		TDQAVEFFIR		DKYEKKKYYD		KNAIAITNIS		SSDAPLQPLV
SSPSLQAAVD		KNKLEKEKEK		KKEEKKREKE		PEKPAKPLTA		EKLQKKDQQL
EPKKSTSPKK		AAEPTVDLLG		LDGPAVAPVT		NGNTTVPPLN		DDLDIFGPMI
SNPLPATVMP		PAQGTPSAPA		AATLSTVTSG		DLDLFTEQTT		KSEEVAKKQL
SKDSILSLYG		TGTIQQQSTP		GVFMGPTNIP		FTSQAPAAFQ		GFPSMGVPVP
AAPGLIGNVM		GQSPSMMVGM		PMPNGFMGNA		QTGVMPLPQN		VVGPQGGMVG
QMGAPQSKFG		LPQAQQPQWS		LSQMNQQMAG		MSISSATPTA		GFGQPSSTTA
GWSGSSSGQT		LSTQLWK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до активаторів гтфаз. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

• Marcos I., Borrego S., Rodriguez de Cordoba S., Galan J.J., Antinolo G. (2002). Cloning, characterization and chromosome mapping of the human SMAP1 gene. Gene. 292: 167—171. PMID 12119110 DOI:10.1016/S0378-1119(02)00645-5
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 6