SMPDL3A

SMPDL3A
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 5EBB, 5EBE
Ідентифікатори
Символи	SMPDL3A, ASM3A, ASML3a, yR36GH4.1, sphingomyelin phosphodiesterase acid like 3A
Зовнішні ІД	OMIM: 610728 MGI: 1931437 HomoloGene: 4886 GeneCards: SMPDL3A
Онтологія гена Молекулярна функція • phosphoric diester hydrolase activity • sphingomyelin phosphodiesterase activity • zinc ion binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • hydrolase activity • зв'язування з іоном металу Клітинна компонента • extracellular region • екзосома • міжклітинний простір Біологічний процес • nucleoside triphosphate catabolic process • sphingomyelin catabolic process Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	10924	57319
Ensembl	ENSG00000172594	ENSMUSG00000019872
UniProt	Q92484	P70158
RefSeq (мРНК)	NM_001286138 NM_006714	NM_020561
RefSeq (білок)	NP_001273067 NP_006705	NP_065586
Локус (UCSC)	Хр. 6: 122.79 – 122.81 Mb	Хр. 10: 57.67 – 57.69 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SMPDL3A (англ. Sphingomyelin phosphodiesterase acid like 3A) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 6-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 453 амінокислот, а молекулярна маса — 51 260.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MALVRALVCC		LLTAWHCRSG		LGLPVAPAGG		RNPPPAIGQF		WHVTDLHLDP
TYHITDDHTK		VCASSKGANA		SNPGPFGDVL		CDSPYQLILS		AFDFIKNSGQ
EASFMIWTGD		SPPHVPVPEL		STDTVINVIT		NMTTTIQSLF		PNLQVFPALG
NHDYWPQDQL		PVVTSKVYNA		VANLWKPWLD		EEAISTLRKG		GFYSQKVTTN
PNLRIISLNT		NLYYGPNIMT		LNKTDPANQF		EWLESTLNNS		QQNKEKVYII
AHVPVGYLPS		SQNITAMREY		YNEKLIDIFQ		KYSDVIAGQF		YGHTHRDSIM
VLSDKKGSPV		NSLFVAPAVT		PVKSVLEKQT		NNPGIRLFQY		DPRDYKLLDM
LQYYLNLTEA		NLKGESIWKL		EYILTQTYDI		EDLQPESLYG		LAKQFTILDS
KQFIKYYNYF		FVSYDSSVTC		DKTCKAFQIC		AIMNLDNISY		ADCLKQLYIK
HNY

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до гідролаз. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Секретований назовні.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Lim S.M., Yeung K., Tresaugues L., Ling T.H., Nordlund P. (2016). The structure and catalytic mechanism of human sphingomyelin phosphodiesterase like 3a - an acid sphingomyelinase homolog with a novel nucleotide hydrolase activity. FEBS J. 283: 1107—1123. PMID 26783088 DOI:10.1111/febs.13655

Див. також

• Хромосома 6