SMTN

SMTN
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2D87
Ідентифікатори
Символи	SMTN, smoothelin
Зовнішні ІД	OMIM: 602127 MGI: 1354727 HomoloGene: 8482 GeneCards: SMTN
Онтологія гена Молекулярна функція • actin binding • structural constituent of muscle Клітинна компонента • цитоплазма • цитоскелет • actin cytoskeleton • центр організації мікротрубочок • filamentous actin • нуклеоплазма Біологічний процес • smooth muscle contraction • muscle organ development • actin cytoskeleton organization Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	6525	29856
Ensembl	ENSG00000183963	ENSMUSG00000020439
UniProt	P53814	Q921U8
RefSeq (мРНК)	NM_001207017 NM_001207018 NM_006932 NM_134269 NM_134270	NM_001159284 NM_001284427 NM_001284428 NM_001284429 NM_013870
RefSeq (білок)	NP_001193946 NP_001193947 NP_008863 NP_599031 NP_599032 NP_001369567 NP_001369568 NP_001369569 NP_001369570 NP_001369571 NP_001369572 NP_001369573 NP_001369574 NP_001369575 NP_001369576 NP_001369577	NP_001152756 NP_001271356 NP_001271357 NP_001271358 NP_038898
Локус (UCSC)	Хр. 22: 31.06 – 31.1 Mb	Хр. 11: 3.47 – 3.49 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SMTN (англ. Smoothelin) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 22-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 917 амінокислот, а молекулярна маса — 99 059.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MADEALAGLD		EGALRKLLEV		TADLAERRRI		RSAIRELQRQ		ELEREEEALA
SKRFRAERQD		NKENWLHSQQ		REAEQRAALA		RLAGQLESMN		DVEELTALLR
SAGEYEERKL		IRAAIRRVRA		QEIEAATLAG		RLYSGRPNSG		SREDSKGLAA
HRLEQCEVPE		REEQEQQAEV		SKPTPTPEGT		SQDVTTVTLL		LRAPPGSTSS
SPASPSSSPT		PASPEPPLEP		AEAQCLTAEV		PGSPEPPPSP		PKTTSPEPQE
SPTLPSTEGQ		VVNKLLSGPK		ETPAAQSPTR		GPSDTKRADV		AGPRPCQRSL
SVLSPRQPAQ		NRESTPLASG		PSSFQRAGSV		RDRVHKFTSD		SPMAARLQDG
TPQAALSPLT		PARLLGPSLT		STTPASSSSG		SSSRGPSDTS		SRFSKEQRGV
AQPLAQLRSC		PQEEGPRGRG		LAARPLENRA		GGPVARSEEP		GAPLPVAVGT
AEPGGSMKTT		FTIEIKDGRG		QASTGRVLLP		TGNQRAELTL		GLRAPPTLLS
TSSGGKSTIT		RVNSPGTLAR		LGSVTHVTSF		SHAPPSSRGG		CSIKMEAEPA
EPLAAAVEAA		NGAEQTRVNK		APEGRSPLSA		EELMTIEDEG		VLDKMLDQST
DFEERKLIRA		ALRELRQRKR		DQRDKERERR		LQEARGRPGE		GRGNTATETT
TRHSQRAADG		SAVSTVTKTE		RLVHSNDGTR		TARTTTVESS		FVRRSENGSG
STMMQTKTFS		SSSSSKKMGS		IFDREDQASP		RAGSLAALEK		RQAEKKKELM
KAQSLPKTSA		SQARKAMIEK		LEKEGAAGSP		GGPRAAVQRS		TSFGVPNANS
IKQMLLDWCR		AKTRGYEHVD		IQNFSSSWSD		GMAFCALVHN		FFPEAFDYGQ
LSPQNRRQNF		EVAFSSAEML		VDCVPLVEVD		DMMIMGKKPD		PKCVFTYVQS
LYNHLRRHEL		RLRGKNV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті.

Література

• van der Loop F.T.L., Schaart G., Timmer E.D.J., Ramaekers F.C.S., van Eys G.J.J.M. (1996). Smoothelin, a novel cytoskeletal protein specific for smooth muscle cells. J. Cell Biol. 134: 401—411. PMID 8707825 DOI:10.1083/jcb.134.2.401
• Kraemer J., Quensel C., Meding J., Cardoso M.C., Leonhardt H. (2001). Identification and characterization of novel smoothelin isoforms in vascular smooth muscle. J. Vasc. Res. 38: 120—132. PMID 11316948 DOI:10.1159/000051039
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 22