SNRPG

SNRPG
Наявні структури PDB Пошук для людей: PDBe RCSB Список кодів PDB 3CW1, 3PGW, 3S6N, 4F7U, 4PJO, 4V98, 4WZJ, 3JCR
Ідентифікатори
Символи	SNRPG, SMG, Sm-G, small nuclear ribonucleoprotein polypeptide G
Зовнішні ІД	OMIM: 603542 HomoloGene: 37730 GeneCards: SNRPG
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding Клітинна компонента • цитоплазма • SMN-Sm protein complex • гіалоплазма • catalytic step 2 spliceosome • spliceosomal tri-snRNP complex • U5 snRNP • U12-type spliceosomal complex • U2 snRNP • methylosome • U7 snRNP • precatalytic spliceosome • small nuclear ribonucleoprotein complex • P granule • spliceosomal complex • U4 snRNP • U2-type prespliceosome • клітинне ядро • Нуклеоплазма • U1 snRNP • U4/U6 x U5 tri-snRNP complex • U2-type precatalytic spliceosome • U2-type catalytic step 2 spliceosome Біологічний процес • termination of RNA polymerase II transcription • mRNA processing • spliceosomal complex assembly • Сплайсинг РНК • histone mRNA metabolic process • import into nucleus • spliceosomal snRNP assembly • mRNA splicing, via spliceosome Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	6637	н/д
Ensembl	ENSG00000143977	н/д
UniProt	P62308 Q49AN9	н/д
RefSeq (мРНК)	NM_003096 NM_001317165 NM_001317166 NM_001317167 NM_001317168 NM_001317169 NM_001317171	н/д
RefSeq (білок)	NP_001304094 NP_001304095 NP_001304096 NP_001304097 NP_001304098 NP_001304100 NP_003087 NP_001304097.1 NP_001304098.1	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 2: 70.28 – 70.29 Mb	н/д
PubMed search		н/д
Вікідані
Див./Ред. для людей

SNRPG (англ. Small nuclear ribonucleoprotein polypeptide G) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 76 амінокислот, а молекулярна маса — 8 496.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSKAHPPELK		KFMDKKLSLK		LNGGRHVQGI		LRGFDPFMNL		VIDECVEMAT
SGQQNNIGMV		VIRGNSIIML		EALERV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін

V: Валін

Кодований геном білок за функцією належить до рибонуклеопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як процесінг мРНК, сплайсінг мРНК. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Pillai R.S., Will C.L., Luehrmann R., Schuemperli D., Mueller B. (2001). Purified U7 snRNPs lack the Sm proteins D1 and D2 but contain Lsm10, a new 14 kDa Sm D1-like protein. EMBO J. 20: 5470—5479. PMID 11574479 DOI:10.1093/emboj/20.19.5470
• Jurica M.S., Licklider L.J., Gygi S.P., Grigorieff N., Moore M.J. (2002). Purification and characterization of native spliceosomes suitable for three-dimensional structural analysis. RNA. 8: 426—439. PMID 11991638 DOI:10.1017/S1355838202021088
• Pomeranz Krummel D.A., Oubridge C., Leung A.K., Li J., Nagai K. (2009). Crystal structure of human spliceosomal U1 snRNP at 5.5 A resolution. Nature. 458: 475—480. PMID 19325628 DOI:10.1038/nature07851
• Leung A.K., Nagai K., Li J. (2011). Structure of the spliceosomal U4 snRNP core domain and its implication for snRNP biogenesis. Nature. 473: 536—539. PMID 21516107 DOI:10.1038/nature09956

Див. також

• Хромосома 2