SNTA1

SNTA1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1QAV, 1Z86, 1Z87, 2ADZ, 2PDZ, 4HOP
Ідентифікатори
Символи	SNTA1, LQT12, SNT1, TACIP1, dJ1187J4.5, Syntrophin, alpha 1, syntrophin alpha 1
Зовнішні ІД	OMIM: 601017 MGI: 101772 HomoloGene: 2331 GeneCards: SNTA1
Пов'язані генетичні захворювання
long QT syndrome 12
Онтологія гена Молекулярна функція • sodium channel regulator activity • nitric-oxide synthase binding • transmembrane transporter binding • ATPase binding • structural molecule activity • calmodulin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • actin binding • PDZ domain binding Клітинна компонента • цитоплазма • lateral plasma membrane • мембрана • neuromuscular junction • клітинна мембрана • внутрішньоклітинний • Міжклітинні контакти • Сарколема • syntrophin complex • Цитоскелет • GO:0009327 protein-containing complex • dystrophin-associated glycoprotein complex • синапс Біологічний процес • м'язове скорочення • negative regulation of peptidyl-cysteine S-nitrosylation • ventricular cardiac muscle cell action potential • регуляція серцевого ритму • regulation of sodium ion transmembrane transport • regulation of ventricular cardiac muscle cell membrane repolarization Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	6640	20648
Ensembl	ENSG00000101400	ENSMUSG00000027488
UniProt	Q13424	Q61234
RefSeq (мРНК)	NM_003098	NM_009228
RefSeq (білок)	NP_003089	NP_033254
Локус (UCSC)	Хр. 20: 33.41 – 33.44 Mb	Хр. 2: 154.22 – 154.25 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SNTA1 (англ. Syntrophin alpha 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 505 амінокислот, а молекулярна маса — 53 895.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MASGRRAPRT		GLLELRAGAG		SGAGGERWQR		VLLSLAEDVL		TVSPADGDPG
PEPGAPREQE		PAQLNGAAEP		GAGPPQLPEA		LLLQRRRVTV		RKADAGGLGI
SIKGGRENKM		PILISKIFKG		LAADQTEALF		VGDAILSVNG		EDLSSATHDE
AVQVLKKTGK		EVVLEVKYMK		DVSPYFKNST		GGTSVGWDSP		PASPLQRQPS
SPGPTPRNFS		EAKHMSLKMA		YVSKRCTPND		PEPRYLEICS		ADGQDTLFLR
AKDEASARSW		ATAIQAQVNT		LTPRVKDELQ		ALLAATSTAG		SQDIKQIGWL
TEQLPSGGTA		PTLALLTEKE		LLLYLSLPET		REALSRPART		APLIATRLVH
SGPSKGSVPY		DAELSFALRT		GTRHGVDTHL		FSVESPQELA		AWTRQLVDGC
HRAAEGVQEV		STACTWNGRP		CSLSVHIDKG		FTLWAAEPGA		ARAVLLRQPF
EKLQMSSDDG		ASLLFLDFGG		AEGEIQLDLH		SCPKTIVFII		HSFLSAKVTR
LGLLA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з молекулою актину, молекулою кальмодуліну, іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, цитоскелеті, мембрані, клітинних контактах.

Література

• Castello A., Brocheriou V., Chafey P., Kahn A., Gilgenkrantz H. (1996). Characterization of the dystrophin-syntrophin interaction using the two-hybrid system in yeast. FEBS Lett. 383: 124—128. PMID 8612778 DOI:10.1016/0014-5793(96)00214-1
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Fernandez-Larrea J., Merlos-Suarez A., Urena J.M., Baselga J., Arribas J. (1999). A role for a PDZ protein in the early secretory pathway for the targeting of proTGF-alpha to the cell surface. Mol. Cell. 3: 423—433. PMID 10230395 DOI:10.1016/S1097-2765(00)80470-0
• Olalla L., Aledo J.C., Bannenberg G., Marquez J. (2001). The C-terminus of human glutaminase L mediates association with PDZ domain-containing proteins. FEBS Lett. 488: 116—122. PMID 11163757 DOI:10.1016/S0014-5793(00)02373-5

Див. також

• Хромосома 20