SNX1

SNX1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2I4K, 4FZS
Ідентифікатори
Символи	SNX1, HsT17379, VPS5, sorting nexin 1
Зовнішні ІД	OMIM: 601272 MGI: 1928395 HomoloGene: 99716 GeneCards: SNX1
Онтологія гена Молекулярна функція • protein homodimerization activity • insulin receptor binding • leptin receptor binding • epidermal growth factor receptor binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • phosphatidylinositol binding • identical protein binding • protein heterodimerization activity • transferrin receptor binding • lipid binding • cadherin binding Клітинна компонента • цитоплазма • гіалоплазма • комплекс Ґольджі • cell projection • early endosome membrane • мембрана • retromer, tubulation complex • внутрішньоклітинна мембранна органела • retromer complex • early endosome • endosome membrane • lamellipodium • extrinsic component of membrane • везикула • лізосома • ендосома • GO:0009327 protein-containing complex Біологічний процес • GO:1903364 positive regulation of protein catabolic process • vesicle organization • early endosome to Golgi transport • receptor internalization • endosomal transport • retrograde transport, endosome to Golgi • protein transport • intracellular protein transport • lamellipodium morphogenesis Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	6642	56440
Ensembl	ENSG00000028528	ENSMUSG00000032382
UniProt	Q13596	Q9WV80
RefSeq (мРНК)	NM_001242933 NM_003099 NM_148955 NM_152826	NM_019727
RefSeq (білок)	NP_001229862 NP_003090 NP_683758	NP_062701
Локус (UCSC)	Хр. 15: 64.09 – 64.15 Mb	Хр. 9: 66 – 66.03 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SNX1 (англ. Sorting nexin 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 15-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 522 амінокислот, а молекулярна маса — 59 070.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MASGGGGCSA		SERLPPPFPG		LEPESEGAAG		GSEPEAGDSD		TEGEDIFTGA
AVVSKHQSPK		ITTSLLPINN		GSKENGIHEE		QDQEPQDLFA		DATVELSLDS
TQNNQKKVLA		KTLISLPPQE		ATNSSKPQPT		YEELEEEEQE		DQFDLTVGIT
DPEKIGDGMN		AYVAYKVTTQ		TSLPLFRSKQ		FAVKRRFSDF		LGLYEKLSEK
HSQNGFIVPP		PPEKSLIGMT		KVKVGKEDSS		SAEFLEKRRA		ALERYLQRIV
NHPTMLQDPD		VREFLEKEEL		PRAVGTQTLS		GAGLLKMFNK		ATDAVSKMTI
KMNESDIWFE		EKLQEVECEE		QRLRKLHAVV		ETLVNHRKEL		ALNTAQFAKS
LAMLGSSEDN		TALSRALSQL		AEVEEKIEQL		HQEQANNDFF		LLAELLSDYI
RLLAIVRAAF		DQRMKTWQRW		QDAQATLQKK		REAEARLLWA		NKPDKLQQAK
DEILEWESRV		TQYERDFERI		STVVRKEVIR		FEKEKSKDFK		NHVIKYLETL
LYSQQQLAKY		WEAFLPEAKA		IS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ліпідами. Локалізований у мембрані, клітинних відростках, апараті гольджі, ендосомах.

Література

• Kurten R.C., Cadena D.L., Gill G.N. (1996). Enhanced degradation of EGF receptors by a sorting nexin, SNX1. Science. 272: 1008—1010. PMID 8638121 DOI:10.1126/science.272.5264.1008
• Haft C.R., de la Luz Sierra M., Barr V.A., Haft D.H., Taylor S.I. (1998). Identification of a family of sorting nexin molecules and characterization of their association with receptors. Mol. Cell. Biol. 18: 7278—7287. PMID 9819414 DOI:10.1128/MCB.18.12.7278
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Gullapalli A., Wolfe B.L., Griffin C.T., Magnuson T., Trejo J. (2006). An essential role for SNX1 in lysosomal sorting of protease-activated receptor-1: evidence for retromer-, Hrs-, and Tsg101-independent functions of sorting nexins. Mol. Biol. Cell. 17: 1228—1238. PMID 16407403 DOI:10.1091/mbc.E05-09-0899
• Bujny M.V., Popoff V., Johannes L., Cullen P.J. (2007). The retromer component sorting nexin-1 is required for efficient retrograde transport of Shiga toxin from early endosome to the trans Golgi network. J. Cell Sci. 120: 2010—2021. PMID 17550970 DOI:10.1242/jcs.003111
• Rojas R., Kametaka S., Haft C.R., Bonifacino J.S. (2007). Interchangeable but essential functions of SNX1 and SNX2 in the association of retromer with endosomes and the trafficking of mannose 6-phosphate receptors. Mol. Cell. Biol. 27: 1112—1124. PMID 17101778 DOI:10.1128/MCB.00156-06

Див. також

• Хромосома 15