SNX2

SNX2
Ідентифікатори
Символи	SNX2, TRG-9, sorting nexin 2
Зовнішні ІД	OMIM: 605929 MGI: 1915054 HomoloGene: 2332 GeneCards: SNX2
Онтологія гена Молекулярна функція • protein homodimerization activity • insulin receptor binding • leptin receptor binding • epidermal growth factor receptor binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • phosphatidylinositol binding • protein heterodimerization activity • transferrin receptor binding • lipid binding • cadherin binding Клітинна компонента • цитоплазма • cell projection • early endosome membrane • мембрана • retromer, tubulation complex • retromer complex • endosome membrane • lamellipodium • extrinsic component of membrane • гіалоплазма • лізосома • ендосома • GO:0009327 protein-containing complex Біологічний процес • ендоцитоз • vesicle organization • early endosome to Golgi transport • retrograde transport, endosome to Golgi • protein complex oligomerization • protein transport • intracellular protein transport • lamellipodium morphogenesis Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	6643	67804
Ensembl	ENSG00000205302	ENSMUSG00000034484
UniProt	O60749	Q9CWK8
RefSeq (мРНК)	NM_003100 NM_001278199	NM_026386 NM_001357463
RefSeq (білок)	NP_001265128 NP_003091	NP_080662 NP_001344392
Локус (UCSC)	Хр. 5: 122.78 – 122.83 Mb	Хр. 18: 53.31 – 53.35 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SNX2 (англ. Sorting nexin 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 519 амінокислот, а молекулярна маса — 58 471.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAAEREPPPL		GDGKPTDFED		LEDGEDLFTS		TVSTLESSPS		SPEPASLPAE
DISANSNGPK		PTEVVLDDDR		EDLFAEATEE		VSLDSPEREP		ILSSEPSPAV
TPVTPTTLIA		PRIESKSMSA		PVIFDRSREE		IEEEANGDIF		DIEIGVSDPE
KVGDGMNAYM		AYRVTTKTSL		SMFSKSEFSV		KRRFSDFLGL		HSKLASKYLH
VGYIVPPAPE		KSIVGMTKVK		VGKEDSSSTE		FVEKRRAALE		RYLQRTVKHP
TLLQDPDLRQ		FLESSELPRA		VNTQALSGAG		ILRMVNKAAD		AVNKMTIKMN
ESDAWFEEKQ		QQFENLDQQL		RKLHVSVEAL		VCHRKELSAN		TAAFAKSAAM
LGNSEDHTAL		SRALSQLAEV		EEKIDQLHQE		QAFADFYMFS		ELLSDYIRLI
AAVKGVFDHR		MKCWQKWEDA		QITLLKKREA		EAKMMVANKP		DKIQQAKNEI
REWEAKVQQG		ERDFEQISKT		IRKEVGRFEK		ERVKDFKTVI		IKYLESLVQT
QQQLIKYWEA		FLPEAKAIA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ліпідами. Локалізований у мембрані, клітинних відростках, ендосомах.

Література

• Haft C.R., de la Luz Sierra M., Barr V.A., Haft D.H., Taylor S.I. (1998). Identification of a family of sorting nexin molecules and characterization of their association with receptors. Mol. Cell. Biol. 18: 7278—7287. PMID 9819414 DOI:10.1128/MCB.18.12.7278
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Fuchs U., Rehkamp G.F., Slany R., Follo M., Borkhardt A. (2003). The formin-binding protein 17, FBP17, binds via a TNKS binding motif to tankyrase, a protein involved in telomere maintenance. FEBS Lett. 554: 10—16. PMID 14596906 DOI:10.1016/S0014-5793(03)01063-9
• Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
• Rojas R., Kametaka S., Haft C.R., Bonifacino J.S. (2007). Interchangeable but essential functions of SNX1 and SNX2 in the association of retromer with endosomes and the trafficking of mannose 6-phosphate receptors. Mol. Cell. Biol. 27: 1112—1124. PMID 17101778 DOI:10.1128/MCB.00156-06
• Lieu Z.Z., Gleeson P.A. (2010). Identification of different itineraries and retromer components for endosome-to-Golgi transport of TGN38 and Shiga toxin. Eur. J. Cell Biol. 89: 379—393. PMID 20138391 DOI:10.1016/j.ejcb.2009.10.021

Див. також

• Хромосома 5