SNX27

SNX27
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4HAS
Ідентифікатори
Символи	SNX27, MRT1, MY014, sorting nexin family member 27, sorting nexin 27
Зовнішні ІД	OMIM: 611541 MGI: 1923992 HomoloGene: 12797 GeneCards: SNX27
Онтологія гена Молекулярна функція • phosphatidylinositol-3-phosphate binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • phosphatidylinositol binding • lipid binding Клітинна компонента • early endosome membrane • мембрана • нуклеоплазма • retromer complex • early endosome • immunological synapse • WASH complex • цитоплазма • ендосома • гіалоплазма Біологічний процес • establishment of natural killer cell polarity • endosome to lysosome transport • endosomal transport • protein transport • intracellular protein transport • GO:0072468 сигнальна трансдукція Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	81609	76742
Ensembl	ENSG00000143376	ENSMUSG00000028136
UniProt	Q96L92	Q3UHD6
RefSeq (мРНК)	NM_030918 NM_001330723	NM_001082484 NM_029721
RefSeq (білок)	NP_001317652 NP_112180	NP_001075953 NP_083997
Локус (UCSC)	Хр. 1: 151.61 – 151.7 Mb	Хр. 3: 94.4 – 94.49 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SNX27 (англ. Sorting nexin family member 27) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 541 амінокислот, а молекулярна маса — 61 265.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MADEDGEGIH		PSAPHRNGGG		GGGGGSGLHC		AGNGGGGGGG		PRVVRIVKSE
SGYGFNVRGQ		VSEGGQLRSI		NGELYAPLQH		VSAVLPGGAA		DRAGVRKGDR
ILEVNHVNVE		GATHKQVVDL		IRAGEKELIL		TVLSVPPHEA		DNLDPSDDSL
GQSFYDYTEK		QAVPISVPRY		KHVEQNGEKF		VVYNVYMAGR		QLCSKRYREF
AILHQNLKRE		FANFTFPRLP		GKWPFSLSEQ		QLDARRRGLE		EYLEKVCSIR
VIGESDIMQE		FLSESDENYN		GVSDVELRVA		LPDGTTVTVR		VKKNSTTDQV
YQAIAAKVGM		DSTTVNYFAL		FEVISHSFVR		KLAPNEFPHK		LYIQNYTSAV
PGTCLTIRKW		LFTTEEEILL		NDNDLAVTYF		FHQAVDDVKK		GYIKAEEKSY
QLQKLYEQRK		MVMYLNMLRT		CEGYNEIIFP		HCACDSRRKG		HVITAISITH
FKLHACTEEG		QLENQVIAFE		WDEMQRWDTD		EEGMAFCFEY		ARGEKKPRWV
KIFTPYFNYM		HECFERVFCE		LKWRKENIFQ		MARSQQRDVA		T

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт, транспорт білків, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ліпідами. Локалізований у цитоплазмі, мембрані, ендосомах.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• MacNeil A.J., Pohajdak B. (2007). Polarization of endosomal SNX27 in migrating and tumor-engaged natural killer cells. Biochem. Biophys. Res. Commun. 361: 146—150. PMID 17644068 DOI:10.1016/j.bbrc.2007.06.183
• MacNeil A.J., Mansour M., Pohajdak B. (2007). Sorting nexin 27 interacts with the Cytohesin associated scaffolding protein (CASP) in lymphocytes. Biochem. Biophys. Res. Commun. 359: 848—853. PMID 17577583 DOI:10.1016/j.bbrc.2007.05.162
• Cai L., Loo L.S., Atlashkin V., Hanson B.J., Hong W. (2011). Deficiency of sorting nexin 27 (SNX27) leads to growth retardation and elevated levels of N-methyl-D-aspartate receptor 2C (NR2C). Mol. Cell. Biol. 31: 1734—1747. PMID 21300787 DOI:10.1128/MCB.01044-10

Див. також

• Хромосома 1