SOBP

SOBP
Ідентифікатори
Символи	SOBP, JXC1, MRAMS, Sobp, sine oculis binding protein homolog
Зовнішні ІД	OMIM: 613667 MGI: 1924427 HomoloGene: 41216 GeneCards: SOBP
Онтологія гена Молекулярна функція • зв'язування з іоном металу • SUMO polymer binding Клітинна компонента • клітинне ядро Біологічний процес • cochlea development • sensory perception of sound • inner ear morphogenesis • когнітивність • locomotory behavior Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	55084	109205
Ensembl	ENSG00000112320	ENSMUSG00000038248
UniProt	A7XYQ1	Q0P5V2
RefSeq (мРНК)	NM_018013	NM_175407
RefSeq (білок)	NP_060483	NP_780616
Локус (UCSC)	Хр. 6: 107.49 – 107.66 Mb	Хр. 10: 42.88 – 43.05 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SOBP (англ. Sine oculis binding protein homolog) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 873 амінокислот, а молекулярна маса — 92 658.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAEMEKEGRP		PENKRSRKPA		HPVKREINEE		MKNFAENTMN		ELLGWYGYDK
VELKDGEDIE		FRSYPTDGES		RQHISVLKEN		SLPKPKLPED		SVISPYNIST
GYSGLATGNG		LSDSPAGSKD		HGSVPIIVPL		IPPPFIKPPA		EDDVSNVQIM
CAWCQKVGIK		RYSLSMGSEV		KSFCSEKCFA		ACRRAYFKRN		KARDEDGHAE
NFPQQHYAKE		TPRLAFKNNC		ELLVCDWCKH		IRHTKEYLDF		GDGERRLQFC
SAKCLNQYKM		DIFYKETQAN		LPAGLCSTLH		PPMENKAEGT		GVQLLTPDSW
NIPLTDARRK		APSPVATAGQ		SQGPGPSAST		TVSPSDTANC		SVTKIPTPVP
KSIPISETPN		IPPVSVQPPA		SIGPPLGVPP		RSPPMVMTNR		GPVPLPIFME
QQIMQQIRPP		FIRGPPHHAS		NPNSPLSNPM		LPGIGPPPGG		PRNLGPTSSP
MHRPMLSPHI		HPPSTPTMPG		NPPGLLPPPP		PGAPLPSLPF		PPVSMMPNGP
MPVPQMMNFG		LPSLAPLVPP		PTLLVPYPVI		VPLPVPIPIP		IPIPHVSDSK
PPNGFSSNGE		NFIPNAPGDS		AAAGGKPSGH		SLSPRDSKQG		SSKSADSPPG
CSGQALSLAP		TPAEHGRSEV		VDLTRRAGSP		PGPPGAGGQL		GFPGVLQGPQ
DGVIDLTVGH		RARLHNVIHR		ALHAHVKAER		EPSAAERRTC		GGCRDGHCSP
PAAGDPGPGA		PAGPEAAAAC		NVIVNGTRGA		AAEGAKSAEP		PPEQPPPPPP
PAPPKKLLSP		EEPAVSELES		VKENNCASNC		HLDGEAAKKL		MGEEALAGGD
KSDPNLNNPA		DEDHAYALRM		LPKTGCVIQP		VPKPAEKAAM		APCIISSPML
SAGPEDLEPP		LKRRCLRIRN		QNK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Sun H., Hunter T. (2012). PolySUMO-binding proteins identified through a string search. J. Biol. Chem. 287: 42071—42083. PMID 23086935 DOI:10.1074/jbc.M112.410985

Див. також

• Хромосома 6