SOCS4

SOCS4
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2IZV
Ідентифікатори
Символи	SOCS4, SOCS7, suppressor of cytokine signaling 4
Зовнішні ІД	OMIM: 616337 MGI: 1914546 HomoloGene: 15442 GeneCards: SOCS4
Онтологія гена Молекулярна функція • protein kinase inhibitor activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • цитоплазма • внутрішньоклітинний Біологічний процес • negative regulation of epidermal growth factor-activated receptor activity • regulation of growth • negative regulation of signal transduction • GO:0007243 intracellular signal transduction • positive regulation of proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process • Убіквітин-залежний протеоліз • cytokine-mediated signaling pathway • negative regulation of receptor signaling pathway via JAK-STAT Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	122809	67296
Ensembl	ENSG00000180008	ENSMUSG00000048379
UniProt	Q8WXH5	Q91ZA6
RefSeq (мРНК)	NM_080867 NM_199421	NM_080843
RefSeq (білок)	NP_543143 NP_955453	NP_543119
Локус (UCSC)	Хр. 14: 55.03 – 55.05 Mb	Хр. 14: 47.51 – 47.53 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SOCS4 (англ. Suppressor of cytokine signaling 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 14-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 440 амінокислот, а молекулярна маса — 50 623.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAENNENISK		NVDVRPKTSR		SRSADRKDGY		VWSGKKLSWS		KKSESYSDAE
TVNGIEKTEV		SLRNQERKHS		CSSIELDLDH		SCGHRFLGRS		LKQKLQDAVG
QCFPIKNCSS		RHSSGLPSKR		KIHISELMLD		KCPFPPRSDL		AFRWHFIKRH
TAPINSKSDE		WVSTDLSQTE		LRDGQLKRRN		MEENINCFSH		TNVQPCVITT
DNALCREGPM		TGSVMNLVSN		NSIEDSDMDS		DDEILTLCTS		SRKRNKPKWD
LDDEILQLET		PPKYHTQIDY		VHCLVPDLLQ		INNNPCYWGV		MDKYAAEALL
EGKPEGTFLL		RDSAQEDYLF		SVSFRRYSRS		LHARIEQWNH		NFSFDAHDPC
VFHSPDITGL		LEHYKDPSAC		MFFEPLLSTP		LIRTFPFSLQ		HICRTVICNC
TTYDGIDALP		IPSSMKLYLK		EYHYKSKVRV		LRIDAPEQQC

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до інгібіторів передачі внутрішньоклітинних сигналів. Задіяний у таких біологічних процесах, як убіквітинування білків, регуляція росту.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Bullock A.N., Rodriguez M.C., Debreczeni J.E., Songyang Z., Knapp S. (2007). Structure of the SOCS4-ElonginB/C complex reveals a distinct SOCS box interface and the molecular basis for SOCS-dependent EGFR degradation. Structure. 15: 1493—1504. PMID 17997974 DOI:10.1016/j.str.2007.09.016

Див. також

• Хромосома 14