SOCS5

SOCS5
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2N34
Ідентифікатори
Символи	SOCS5, CIS6, CISH6, Cish5, SOCS-5, suppressor of cytokine signaling 5
Зовнішні ІД	OMIM: 607094 MGI: 2385459 HomoloGene: 10495 GeneCards: SOCS5
Онтологія гена Молекулярна функція • epidermal growth factor receptor binding • protein kinase inhibitor activity • receptor tyrosine kinase binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • 1-phosphatidylinositol-3-kinase regulator activity Клітинна компонента • цитоплазма • гіалоплазма • phosphatidylinositol 3-kinase complex Біологічний процес • receptor signaling pathway via JAK-STAT • GO:0007243 intracellular signal transduction • epidermal growth factor receptor signaling pathway • negative regulation of epidermal growth factor-activated receptor activity • cell growth • Убіквітин-залежний протеоліз • regulation of growth • positive regulation of proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process • negative regulation of receptor signaling pathway via JAK-STAT • negative regulation of T-helper 2 cell differentiation • positive regulation of T-helper 1 cell differentiation • negative regulation of signal transduction • negative regulation of interleukin-6 production • negative regulation of inflammatory response • cellular response to low-density lipoprotein particle stimulus • negative regulation of monocyte chemotactic protein-1 production • vascular endothelial cell response to fluid shear stress • посттрансляційна модифікація • cytokine-mediated signaling pathway • regulation of phosphatidylinositol 3-kinase activity • phosphatidylinositol phosphate biosynthetic process Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	9655	56468
Ensembl	ENSG00000171150	ENSMUSG00000037104
UniProt	O75159	O54928
RefSeq (мРНК)	NM_144949 NM_014011	NM_019654
RefSeq (білок)	NP_054730 NP_659198	NP_062628
Локус (UCSC)	Хр. 2: 46.7 – 46.78 Mb	Хр. 17: 87.42 – 87.45 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SOCS5 (англ. Suppressor of cytokine signaling 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 536 амінокислот, а молекулярна маса — 61 246.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MDKVGKMWNN		FKYRCQNLFG		HEGGSRSENV		DMNSNRCLSV		KEKNISIGDS
TPQQQSSPLR		ENIALQLGLS		PSKNSSRRNQ		NCATEIPQIV		EISIEKDNDS
CVTPGTRLAR		RDSYSRHAPW		GGKKKHSCST		KTQSSLDADK		KFGRTRSGLQ
RRERRYGVSS		VHDMDSVSSR		TVGSRSLRQR		LQDTVGLCFP		MRTYSKQSKP
LFSNKRKIHL		SELMLEKCPF		PAGSDLAQKW		HLIKQHTAPV		SPHSTFFDTF
DPSLVSTEDE		EDRLRERRRL		SIEEGVDPPP		NAQIHTFEAT		AQVNPLYKLG
PKLAPGMTEI		SGDSSAIPQA		NCDSEEDTTT		LCLQSRRQKQ		RQISGDSHTH
VSRQGAWKVH		TQIDYIHCLV		PDLLQITGNP		CYWGVMDRYE		AEALLEGKPE
GTFLLRDSAQ		EDYLFSVSFR		RYNRSLHARI		EQWNHNFSFD		AHDPCVFHSS
TVTGLLEHYK		DPSSCMFFEP		LLTISLNRTF		PFSLQYICRA		VICRCTTYDG
IDGLPLPSML		QDFLKEYHYK		QKVRVRWLER		EPVKAK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до інгібіторів трансдукції сигналу. Задіяний у таких біологічних процесах як убіквітинування білків, регуляція росту.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 2