SOCS6

SOCS6
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2VIF
Ідентифікатори
Символи	SOCS6, CIS-4, CIS4, HSPC060, SOCS-4, SOCS-6, SOCS4, SSI4, STAI4, STATI4, suppressor of cytokine signaling 6
Зовнішні ІД	OMIM: 605118 MGI: 1924885 HomoloGene: 3120 GeneCards: SOCS6
Онтологія гена Молекулярна функція • protein kinase inhibitor activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • 1-phosphatidylinositol-3-kinase regulator activity Клітинна компонента • цитоплазма • immunological synapse • гіалоплазма • phosphatidylinositol 3-kinase complex Біологічний процес • regulation of growth • defense response • proteasomal protein catabolic process • receptor signaling pathway via JAK-STAT • negative regulation of signal transduction • GO:0007243 intracellular signal transduction • negative regulation of T cell activation • Убіквітин-залежний протеоліз • negative regulation of protein kinase activity • cytokine-mediated signaling pathway • negative regulation of receptor signaling pathway via JAK-STAT • посттрансляційна модифікація • regulation of phosphatidylinositol 3-kinase activity • phosphatidylinositol phosphate biosynthetic process Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	9306	54607
Ensembl	ENSG00000170677	ENSMUSG00000056153
UniProt	O14544	Q9JLY0
RefSeq (мРНК)	NM_004232 NM_016387	NM_018821
RefSeq (білок)	NP_004223	NP_061291
Локус (UCSC)	Хр. 18: 70.29 – 70.33 Mb	Хр. 18: 88.68 – 88.95 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SOCS6 (англ. Suppressor of cytokine signaling 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 18-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 535 амінокислот, а молекулярна маса — 59 528.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MKKISLKTLR		KSFNLNKSKE		ETDFMVVQQP		SLASDFGKDD		SLFGSCYGKD
MASCDINGED		EKGGKNRSKS		ESLMGTLKRR		LSAKQKSKGK		AGTPSGSSAD
EDTFSSSSAP		IVFKDVRAQR		PIRSTSLRSH		HYSPAPWPLR		PTNSEETCIK
MEVRVKALVH		SSSPSPALNG		VRKDFHDLQS		ETTCQEQANS		LKSSASHNGD
LHLHLDEHVP		VVIGLMPQDY		IQYTVPLDEG		MYPLEGSRSY		CLDSSSPMEV
SAVPPQVGGR		AFPEDESQVD		QDLVVAPEIF		VDQSVNGLLI		GTTGVMLQSP
RAGHDDVPPL		SPLLPPMQNN		QIQRNFSGLT		GTEAHVAESM		RCHLNFDPNS
APGVARVYDS		VQSSGPMVVT		SLTEELKKLA		KQGWYWGPIT		RWEAEGKLAN
VPDGSFLVRD		SSDDRYLLSL		SFRSHGKTLH		TRIEHSNGRF		SFYEQPDVEG
HTSIVDLIEH		SIRDSENGAF		CYSRSRLPGS		ATYPVRLTNP		VSRFMQVRSL
QYLCRFVIRQ		YTRIDLIQKL		PLPNKMKDYL		QEKHY

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до інгібіторів передачі внутрішньоклітинних сигналів. Задіяний у таких біологічних процесах, як убіквітинування білків, регуляція росту.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Ronnstrand L. (2004). Signal transduction via the stem cell factor receptor/c-Kit. Cell. Mol. Life Sci. 61: 2535—2548. PMID 15526160 DOI:10.1007/s00018-004-4189-6

Див. також

• Хромосома 18