SP140L

SP140L
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2MD7, 2MD8
Ідентифікатори
Символи	SP140L, SP140 nuclear body protein like
Зовнішні ІД	OMIM: 617747 HomoloGene: 131080 GeneCards: SP140L
Онтологія гена Молекулярна функція • зв'язування з іоном металу • DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • клітинне ядро • ядерні тільця Біологічний процес • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	93349	316580
Ensembl	ENSG00000185404	ENSRNOG00000022800
UniProt	Q9H930	Q66H87
RefSeq (мРНК)	NM_001308162 NM_001308163 NM_138402 NM_001352892 NM_001352893 NM_001352894	NM_001012133
RefSeq (білок)	NP_001295091 NP_001295092 NP_612411 NP_001339821 NP_001339822 NP_001339823	NP_001012133
Локус (UCSC)	Хр. 2: 230.33 – 230.4 Mb	н/д
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SP140L (англ. SP140 nuclear body protein like) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 580 амінокислот, а молекулярна маса — 67 005.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAGGGSDLST		RGLNGGVSQV		ANEMNHLPAH		SQSLQRLFTE		DQDVDEGLVY
DTVFKHFKRH		KLEISNAIKK		TFPFLEGLRD		RELITNKMFE		DSEDSCRNLV
PVQRVVYNVL		SELEKTFNLS		VLEALFSEVN		MQEYPDLIHI		YKSFKNAIQD
KLSFQESDRK		EREERPDIKL		SLKQGEVPES		PEARKESDQA		CGKMDTVDIA
NNSTLGKPKR		KRRKKKGHGW		SRMGTRTQKN		NQQNDNSKAD		GQLVSSEKKA
NMNLKDLSKI		RGRKRGKPGT		HFTQSDRAPQ		KRVRSRASRK		HKDETVDFQA
PLLPVTCGGV		KGILHKEKLE		QGTLAKCIQT		EDGKWFTPME		FEIKGGYARS
KNWRLSVRCG		GWPLRRLMEE		GSLPNPPRIY		YRNKKRILKS		QNNSSVDPCM
RNLDECEVCR		DGGELFCCDT		CSRVFHEDCH		IPPVESEKTP		WNCIFCRMKE
SPGSQQCCQE		SEVLERQMCP		EEQLKCEFLL		LKVYCCSESS		FFAKIPYYYY
IREACQGLKE		PMWLDKIKKR		LNEHGYPQVE		GFVQDMRLIF		QNHRASYKYK
DFGQMGLRLE		AEFEKDFKEV		FAIQETNGNS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 2