SPATA13

SPATA13
Ідентифікатори
Символи	SPATA13, ARHGEF29, ASEF2, spermatogenesis associated 13
Зовнішні ІД	OMIM: 613324 MGI: 104838 HomoloGene: 19482 GeneCards: SPATA13
Пов'язані генетичні захворювання
Розщеплення піднебіння, alcohol dependence
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • guanyl-nucleotide exchange factor activity • identical protein binding Клітинна компонента • цитоплазма • Філоподія • ruffle membrane • клітинна мембрана • cell projection • мембрана • lamellipodium • нуклеоплазма • гіалоплазма Біологічний процес • filopodium assembly • regulation of Rho protein signal transduction • regulation of cell migration • cell migration • lamellipodium assembly Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	221178	219140
Ensembl	н/д	ENSMUSG00000021990
UniProt	Q96N96	Q5DU57
RefSeq (мРНК)	NM_001166271 NM_001286792 NM_001286793 NM_001286794 NM_001286795 NM_153023	NM_001033272 NM_001310594
RefSeq (білок)	NP_001159743 NP_001273721 NP_001273722 NP_001273723 NP_001273724 NP_694568 NP_694568.1	NP_001028444 NP_001297523 NP_001391878 NP_001391879 NP_001391880 NP_001391881 NP_001391882 NP_001391883 NP_001391893
Локус (UCSC)	н/д	Хр. 14: 60.87 – 61 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SPATA13 (англ. Spermatogenesis associated 13) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 13-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 652 амінокислот, а молекулярна маса — 74 820.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MTSASPEDQN		APVGCPKGAR		RRRPISVIGG		VSLYGTNQTE		ELDNLLTQPA
SRPPMPAHQV		PPYKAVSARF		RPFTFSQSTP		IGLDRVGRRR		QMRASNVSSD
GGTEPSALVD		DNGSEEDFSY		EDLCQASPRY		LQPGGEQLAI		NELISDGNVV
CAEALWDHVT		MDDQELGFKA		GDVIQVLEAS		NKDWWWGRSE		DKEAWFPASF
VRLRVNQEEL		SENSSSTPSE		EQDEEASQSR		HRHCENKQQM		RTNVIREIMD
TERVYIKHLR		DICEGYIRQC		RKHTGMFTVA		QLATIFGNIE		DIYKFQRKFL
KDLEKQYNKE		EPHLSEIGSC		FLQNQEGFAI		YSEYCNNHPG		ACLELANLMK
QGKYRHFFEA		CRLLQQMIDI		AIDGFLLTPV		QKICKYPLQL		AELLKYTTQE
HGDYSNIKAA		YEAMKNVACL		INERKRKLES		IDKIARWQVS		IVGWEGLDIL
DRSSELIHSG		ELTKITKQGK		SQQRTFFLFD		HQLVSCKKDL		LRRDMLYYKG
RLDMDEMELV		DLGDGRDKDC		NLSVKNAFKL		VSRTTDEVYL		FCAKKQEDKA
RWLQACADER		RRVQEDKEMG		MEISENQKKL		AMLNAQKAGH		GKSKGYNRCP
VAPPHQGLHP		IHQRHITMPT		SVPQQQVFGL		AEPKRKSSLF		WHTFNRLTPF
RK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, мембрані, клітинних відростках.

Література

• Hamann M.J., Lubking C.M., Luchini D.N., Billadeau D.D. (2007). Asef2 functions as a Cdc42 exchange factor and is stimulated by the release of an autoinhibitory module from a concealed C-terminal activation element. Mol. Cell. Biol. 27: 1380—1393. PMID 17145773 DOI:10.1128/MCB.01608-06
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 13