SPATA5

SPATA5
Ідентифікатори
Символи	SPATA5, AFG2, SPAF, EHLMRS, spermatogenesis associated 5, NEDHSB
Зовнішні ІД	OMIM: 613940 MGI: 1927170 HomoloGene: 56920 GeneCards: SPATA5
Пов'язані генетичні захворювання
microcephaly-intellectual disability-sensorineural hearing loss-epilepsy-abnormal muscle tone syndrome
Онтологія гена Молекулярна функція • nucleotide binding • ATP binding • ATPase activity • hydrolase activity Клітинна компонента • цитоплазма • мітохондрія Біологічний процес • multicellular organism development • диференціація клітин • brain development • Сперматогенез Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	166378	57815
Ensembl	ENSG00000145375	ENSMUSG00000027722
UniProt	Q8NB90	Q3UMC0
RefSeq (мРНК)	NM_145207 NM_001317799 NM_001345856	NM_001163511 NM_021343 NM_001310473
RefSeq (білок)	NP_001304728 NP_001332785 NP_660208	NP_001156983 NP_001297402 NP_067318
Локус (UCSC)	Хр. 4: 122.92 – 123.32 Mb	Хр. 3: 37.47 – 37.63 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SPATA5 (англ. Spermatogenesis associated 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 893 амінокислот, а молекулярна маса — 97 904.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSSKKNRKRL		NQSAENGSSL		PSAASSCAEA		RAPSAGSDFA		ATSGTLTVTN
LLEKVDDKIP		KTFQNSLIHL		GLNTMKSANI		CIGRPVLLTS		LNGKQEVYTA
WPMAGFPGGK		VGLSEMAQKN		VGVRPGDAIQ		VQPLVGAVLQ		AEEMDVALSD
KDMEINEEEL		TGCILRKLDG		KIVLPGNFLY		CTFYGRPYKL		QVLRVKGADG
MILGGPQSDS		DTDAQRMAFE		QSSMETSSLE		LSLQLSQLDL		EDTQIPTSRS
TPYKPIDDRI		TNKASDVLLD		VTQSPGDGSG		LMLEEVTGLK		CNFESAREGN
EQLTEEERLL		KFSIGAKCNT		DTFYFISSTT		RVNFTEIDKN		SKEQDNQFKV
TYDMIGGLSS		QLKAIREIIE		LPLKQPELFK		SYGIPAPRGV		LLYGPPGTGK
TMIARAVANE		VGAYVSVING		PEIISKFYGE		TEAKLRQIFA		EATLRHPSII
FIDELDALCP		KREGAQNEVE		KRVVASLLTL		MDGIGSEVSE		GQVLVLGATN
RPHALDAALR		RPGRFDKEIE		IGVPNAQDRL		DILQKLLRRV		PHLLTEAELL
QLANSAHGYV		GADLKVLCNE		AGLCALRRIL		KKQPNLPDVK		VAGLVKITLK
DFLQAMNDIR		PSAMREIAID		VPNVSWSDIG		GLESIKLKLE		QAVEWPLKHP
ESFIRMGIQP		PKGVLLYGPP		GCSKTMIAKA		LANESGLNFL		AIKGPELMNK
YVGESERAVR		ETFRKARAVA		PSIIFFDELD		ALAVERGSSL		GAGNVADRVL
AQLLTEMDGI		EQLKDVTILA		ATNRPDRIDK		ALMRPGRIDR		IIYVPLPDAA
TRREIFKLQF		HSMPVSNEVD		LDELILQTDA		YSGAEIVAVC		REAALLALEE
DIQANLIMKR		HFTQALSTVT		PRIPESLRRF		YEDYQEKSGL		HTL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як диференціація, сперматогенез, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у цитоплазмі, мітохондрії.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 4